1、閉合程度區別：金錢龜縮到龜殼中，其甲殼完全封閉；石金錢龜縮到龜殼中，其龜殼上有四個孔。2、外觀區別：頭部為蛇頭形且頭頂部有黃色菱形標志，背部有三條隆起的黑色縱線；石金錢龜頭部為扁圓狀且為橄欖綠色，背部只有一條明顯黑線。3、腹甲區別：金錢龜腹甲橫斷，由韌帶相連；石金錢龜腹甲為黃色，且每塊盾甲外側有大墨漬斑。
一、閉合程度區別
1、金錢龜：金錢龜的頭和四肢全部縮到龜殼里，其甲殼可以完全封閉。
2、石金錢龜：雖然頭和四肢都能縮到龜殼中，但龜殼上有四個孔，不是完全閉合。
二、外觀區別
1、金錢龜：頭部為蛇頭形且頭頂部有黃色菱形標志，背部為棕黃或灰黑色，且有三條隆起的黑色縱線。
2、石金錢龜：頭部為扁圓狀，頭頂平滑且呈橄欖綠色。
三、腹甲區別
1、金錢龜：腹甲橫斷，由韌帶相連。
2、石金錢龜：腹甲為黃色，且每塊盾甲外側有大墨漬斑。
四、背甲區別
1、金錢龜：背甲邊緣周圍為金桔黃色。
2、石金錢龜：背甲扁平，為棕黃綠色或棕黑色，且有三條脊棱，后緣略呈鋸齒狀。
金錢龜頭部呈蛇頭形，頭部又呈黃色或橄欖色，石金錢龜頭部略微扁圓。 3、背部三線 金錢龜背部呈棕黃色或灰黑色，有明顯三條隆起的黑色縱線，以中間的一條隆起最為明顯和最長，故又被稱為川字背龜。而石金錢龜沒有該特征。金錢龜頭部呈蛇頭形，頭部又呈黃色或橄欖色，石金錢龜頭部略微扁圓。 3、背部三線 金錢龜背部呈棕黃色或灰黑色，有明顯三條隆起的黑色縱線，以中間的一條隆起最為明顯和最長，故又被稱為川字背龜。而石金錢龜沒有該特征。
