1、耐旱性不同：巨菌草的耐旱能力強于皇竹草。2、適口性不同：皇竹草葉片上絨毛較多，口感較差；巨菌草葉嫩多汁、適口性強。3、營養成分不同：巨菌草粗蛋白含量高達18.46%，皇竹草為12.3%；巨菌草水分為11%，皇竹草為6%。4、產量不同：巨菌草產量比皇竹草高，巨菌草產量海南基地示范地塊上畝產可達32噸，而皇竹草產量僅為巨菌草的60%左右。
一、耐旱性不同
巨菌草的耐旱能力強于皇竹草。巨菌草和皇竹草在菌草中心海南基地經過8、9月份的高溫、干旱考驗，在不澆水的情況下，皇竹草第36天旱死，而巨菌草在9月份測試結束后依舊存活。
二、適口性不同
皇竹草葉片上絨毛較多，口感較差。巨菌草葉嫩多汁、適口性強、富含多種微量元素，牛羊等食草性動物都比較喜歡食用。
三、營養成分不同
巨菌草粗蛋白含量高達18.46%，皇竹草為12.3%；巨菌草水分為11%，皇竹草為6%；巨菌草富含硒、鎂、鋅、磷、鉀、鈣等10多種微量元素，皇竹草僅含6種。
四、產量不同
1、巨菌草分蘗能力強于皇竹草，因此產量比皇竹草高出許多，巨菌草產量海南基地示范地塊上畝產可達32噸，而皇竹草產量僅為巨菌草的60%左右。
2、種植一畝巨菌草可供3-5頭牛，30-35只羊。種植一畝皇竹草可供1.8-3頭牛，18-21只羊。
3、從生長能力來看，菌草中心院內的展示巨菌草已經存活40年，皇竹草僅為6年（根據記錄顯示）。
