1、科屬不同：問荊為木賊科問荊屬中小型蕨類植物；節節草是木賊科木賊屬植物節節草的全草。2、外形不同：問荊根莖斜升，直立和橫走，黑棕色；節節草根莖黑褐色，生少數黃色須根。3、習性不同：問荊生于海拔0-3700米的渠旁、沙土地等處；節節草各地均有分布。4、高度不同：問荊0.6米高；節節草有1米左右高。
一、科屬不同
1、問荊為木賊科問荊屬中小型蕨類植物，在我國的各個省份均有分布。
2、節節草是木賊科木賊屬植物節節草的全草，是我國的一種農田雜草。
二、外形不同
1、問荊：根莖斜升，直立和橫走，黑棕色，節和根密生黃棕色長毛或光滑無毛。地上枝當年枯萎。枝二型。能育枝春季先萌發，高5-35厘米，中部直徑3-5毫米，節間長2-6厘米，黃棕色，無輪莖分枝，脊不明顯，要密縱溝，不育枝后萌發，高達40厘米，主枝中部直徑1.5-3.0毫米，節間長2-3厘米，綠色，輪生分枝多，主枝中部以下有分枝。
2、節節草：根莖為深褐色，有少量黃色須根。莖直立，單生或叢生，高達70厘米，直徑1-2毫米，灰綠色，肋棱6-20條，粗糙，有小疣狀突起1列；溝中氣孔線1-4列；中部以下多分枝，分枝常具2-5小枝。
三、習性不同
1、問荊：生于海拔0-3700米的潮濕草地、溝渠旁、沙土地、耕地、山坡和草甸等處。
2、節節草：主要生長在海拔100-3300米的濕地、溪流、海邊、水田邊等處，我國各個地方均有分布，隨處可見。
四、高度不同
1、問荊：問荊地上莖有兩種，即孢子莖和營養莖，孢子莖肉質不分枝，為紫褐色，鞘長而大。營養莖在孢子莖枯萎后出生，0.6米高，有縱棱6-15條。
2、節節草：節節草的莖分為根狀莖和地上莖兩部分。根狀莖黑色地上莖直立，基部分枝，沒有營養莖與孢子莖的區別，有1米左右高，莖中空。
