發酵床養兔的兔舍建設根據當地風向情況，選地勢高燥地帶建設，可以建設大棚發酵床養兔舍，大棚兩端順風向設定，長寬比為3比1左右，高3.2米左右，深挖地下30公分以上，北方則要40公分以上（也可以在泥土地面上四周砌30-40公分高度的擋土墻，但同時兔舍也需加高30到40公分），以填入墊料。地上式的更為簡單一些，也適用于舊兔舍的改造，只需要在舊兔舍內的四周，用相應的材料（如磚塊、土坯、土埂、木板、或其他當地可利用的材料）做30～40公分高的擋土墻即可，地面是泥地，墊料30～40公分的墊料，加入菌液即可以了。也可以采用半地下式的，即把兔棚中間的泥地挖一點，如挖15公分深，挖出的泥土，可以直接堆放到大棚四周，作為擋土墻之用，起到了就地取材的作用。總之，只要空出高度為30～40公分的空間，放置發酵床墊料即可，再在上面蓋上養兔的大棚即可。同時，在兔舍外另外單獨建設一個隔離欄舍，以備病兔隔離治療處理之用。
兔子有愛干凈，喜歡干燥怕潮濕的特性，在兔舍里它會在固定地點方便(通常是在放飼料的另一邊角落)，傳統的養兔方法需要不時的給兔子清糞尿，兔尿非常臭，量又多，稍稍清理不勤就會滿室“清香”，兔子會受不了。而用發酵床養兔就有效避免了這種情況的出現，主要有以下四大好處：
1、除臭環保
發酵床養兔不需每天清理兔舍，糞便和墊料在發酵床功能微生物菌群的作用下，一部分被轉化成無臭氣體被排放掉，例如：水蒸氣和CO2；另一部分轉化為粗蛋白、菌體蛋白和維生素等營養物質。同時發酵功能菌群抑制降解蛋白質的異化細菌，阻止蛋白分解產生吲哚等臭味物質。從源頭上消除了對生態環境的污染，圈內變得衛生干凈，人畜工作環境、生活環境得到大大改善，達到零排放，實現了養殖業與環境的和諧發展。
2、節能省糧
兔的糞便在發酵床上一般只需三天就會被微生物分解，糞便給微生物提供了豐富營養，促使有益菌不斷繁殖，形成菌體蛋白，兔子吃了這些菌體蛋白不但補充了營養，還能提高免疫力，且發酵床表層溫度不管春夏秋冬均保持在20幾度，發酵產生的熱量使兔舍內供暖的煤電使用大大減少，一般可節省一半以上。
3、抗病促長
發酵床，因發酵層內升溫發酵，能殺滅多種蟲卵與病原菌，而且舍內干燥舒服，使兔子不易生病、少生病，增重快、肉質好，水分少。
4、廢物利用
發酵后的墊料與兔子糞尿混和物是高檔優質生物有機肥或粗飼料，營養豐富、疏松通氣、無臭味、外觀漂亮、不燒根不燒苗，可廣泛用于苗木花卉營養土、經濟作物果樹蔬菜或其他動物粗飼料等。
用發酵床養兔子有這么多的好處，那么如何制作兔舍發酵床呢：
1、準備墊料。發酵床墊料最好用鋸末。如果鋸末少或者價格高，也可以用刨花、稻殼、花生殼、玉米芯及各種農作物秸桿部分代替，禁止使用發霉和有毒的墊料，墊料中的塑料類雜物一定要檢干凈。每平米兔舍發酵床大約需墊料0.4方。
2、稀釋菌種。將發酵劑按1:5～10倍比例與玉米面、麩皮或米糠混合均勻（每公斤即每袋發酵劑可以做15-20平米），分成4等份。
3、鋪墊料和菌種。將墊料原料分四層鋪填，每鋪一層，上面就均勻撒一層菌種，這樣操作比較省力。也可以先將墊料與菌種混合均勻后一次鋪成。
4、放兔入床。墊料鋪成后可立即飼養。如果墊料鋪成后空置一段時間才放兔，只要時間不是太長（一兩個月內），發酵床發酵功能基本不受影響。金寶貝發酵菌種在混有兔子糞便的墊料中會迅速啟動發酵。在未摻和兔子糞便的干墊料中菌種保持休眠狀態。
最后也有一些要注意的事項：母兔繁殖時要將母兔放置于籠子內，避免母免在發酵床上打洞生育仔兔后，洞塌陷，仔兔窒息而死。兔子放養的密度要掌握好，太密單位面積糞尿太多，發酵床超負荷運轉，不能有效分解糞便，每個平方米3～4只（4～5斤重的兔子）即可。
