一看整齊度。混有其他稻谷的雜交稻種子粒型不整齊。混入的父本或其他秈稻明顯比雜交黑米種子細長飽滿，而粳稻谷則較圓。
二看谷殼色。雜交黑米種子谷殼上略帶不均勻的黃褐色等生理性雜色，而父本、保持系谷粒顏色較一致，保持系和其他混雜谷粒比雜交黑米種子透明度高，谷殼比雜交黑米種子光滑。
三看柱頭痕跡。非雜交黑米谷粒因多屬于自花授粉，雌蕊柱頭不外露，柱頭痕跡遺留在谷殼內部，剝開谷殼在米粒頂部可見一點淺黑色的柱頭痕跡。而雜交種屬異花授粉，柱頭外露，仔細觀察谷粒內外稃夾縫中間，可發現一點不很明顯的小黑點即柱頭痕跡，這是識別雜交黑米種子和其他稻粒的重要依據。
四看染色測定。方法是把稻谷殼自胚部縱切成兩半，取每粒的一半清洗放入稀釋成60倍液的紅墨水中浸漬，1小時后取出用清水沖選，如果種胚沒染色或染色較淺，證明種子有活力；若染色較深，證明種子已喪失活力。這樣便可識別出雜交種子里不發芽的變質種子。
五看種子純凈度。用手抄一下種子，掌上指縫間有固體顆粒如土粒、砂粒等雜質，手指沾有細粉狀物，證明種子純凈度達不到國家規定的標準（99%）.
六看種子含水量。簡便的方法是用牙咬谷粒，如有尖脆響聲，則含水量基本正常；若無尖脆聲或谷粒斷面不整齊，則種子含水量一般高于正常標準（11.5%）.
七看種子"三證".凡有種子經營許可證、質量合格證和植保部門病蟲檢疫證的種子，為優質雜交黑米種子。否則為假劣雜交黑米種子。
