適時收獲紅薯收獲過早，產量較低；收獲過晚，易遭受凍，影響貯藏。所以，一般最好在氣溫18℃左右時開始收獲，氣溫在10℃以上時(即枯霜期前)收獲完畢。一般先收切干用的春瓜地，再收作種用的夏紅薯。
精選瓜塊在收獲選留好紅薯品種時，一定要精心刨割，避免外傷。為了多出苗、出壯苗和降低成本，應選塊根150―200克的瓜塊作種。所選的瓜塊要無病、無澇害，還要具有本品種的典型特性。收獲時，最好早晨割秧，上午收刨，下午入窖。
入窖貯藏用大屋窖或地窖貯藏，瓜種入窖前要對舊窖嚴格消毒，如用50%多菌靈600倍液或5%安索菌毒清水劑500倍液等噴灑瓜窖消毒。存放紅薯時，每存一層紅薯，就用“紅薯保險劑”稀釋液均勻噴灑一遍。
現將大屋窖貯藏紅薯的特殊管理措施介紹如下：
瓜種入窖前期(入窖15―20天)，應先加溫18―24小時，使窖內溫度達到35℃―38℃，保持四晝夜。以后打開天窗，排濕降溫，經18―24小時，使窖溫降至15℃；貯藏中期(入窖后20天到第二年春2月初)，主要是保溫、升溫，以防止瓜種受冷害，此時的窖溫應穩定在12℃―13℃；貯藏后期(2月初到育苗)及時開窖檢查，排除多余的二氧化碳。用以上方法儲藏的紅薯，保鮮時間長，紅薯完好率達96%以上。
