針對改革完善糧食收購制度，綱要提出穩步推進糧食收購資金來源多元化，滿足糧食收購資金需求。還要適應糧食生產組織方式變化，創新糧食收購方式，引導企業與種糧大戶、家庭農場、農民合作社等新型糧食生產經營主體對接，開展訂單收購、預約收購、代收代儲、代加工等個性化服務，構建渠道穩定、運行規范、方便農民的新型糧食收購網絡體系。依法開展糧食收購資格審核，規范收購秩序。
據了解，我國2004年全面放開糧食市場的同時，中央提出了價格調控的主要手段，對稻谷和小麥兩大品種實行最低收購價制度。政府有關部門根據農民生產成本和獲得必要利潤作為基礎，經過嚴密測算，確定下一年度的最低收購價格。當市場糧價低于這個收購價時，國家委托符合一定資質條件的糧食企業，按國家確定的最低收購價收購農民的糧食。之后，政府擴大了價格調控的農產品種類，玉米也被納入，臨時收儲收購政策應時而生。
多位專家表示，最低收購價和臨時收儲政策在當時的農業生產環境下起到了積極的作用，保證了國內糧價的基本穩定。但是，在“托市”政策的支撐下，2011年下半年以來國內糧價持續上漲，逐步超過進口糧價，倒掛趨勢愈發嚴重，極大地刺激了糧食進口數量的快速增長。此外，由于企業收購成本居高不下，處于產業鏈下游的糧食加工產業整體發展陷入困境。
在多重壓力下，2014年中央決定開始探索推進農產品價格形成機制與政府補貼“脫鉤”的改革，決定先期對東北大豆、新疆棉花進行目標價格補貼試點。
所謂目標價格制度，是指由政府設定農產品的目標價格，當市場價格高于目標價格時，補貼低收入者；當市場價格低于目標價格時，按差價補貼生產者。此前有消息稱，中國未來有可能也會對小麥和稻谷實施目標價格改革，但專家表示，從此次出臺的綱要可以看出，至少未來五年內，這兩大品種的價格形成還難以與政府補貼“脫鉤”。
值得一提的是，多年來玉米的臨時收儲價格只漲不跌，成了糧價上漲的重要支撐。而針對目前庫存結余量巨大的玉米，綱要明確提出“十三五”期間，要積極穩妥推進玉米收儲制度改革。對此，國家糧油信息中心副主任王曉輝表示，玉米是需求量大、產業鏈條長、國內外市場關聯程度高的品種。收儲政策的調整要堅持兩個方向。一是堅持市場定價的原則，讓市場在資源配置過程中起決定性作用；二是要推進農產品價補分離。
