1 查苗補苗破殼
芝麻播后5～6d，如不能及時出苗或出苗不全，應立即查找原因，采取措施。對缺苗嚴重的，要及早重播；局部缺苗的，應用同一品種及時催芽補種；少量缺苗的，可移苗補栽。播后遇雨，雨后猛晴，地面的碎土易形成硬殼，應在播后3～4d內，用釘耙橫耙1～2遍，以破除板結，助苗出土。
2 間苗、定苗
芝麻齊苗后要及時間苗，“要吃芝麻油，先破十字頭”，即在第1對真葉時進行第1次間苗，將成團的苗散開，拔除過密苗。2～3對真葉時第2次間苗并預行定苗，一般在芝麻長出第4對真葉時定苗。定苗時間不宜過早，尤其在病蟲害嚴重的年份，應適當多間苗，并在行上預留一些健壯苗以做補苗用。移苗前須灌透水，帶土移栽，移栽多在傍晚或陰天進行，移后澆水覆土以利成活。間苗定苗要遵循“密留稀，稀留密，不稀不密留壯的”的原則，按計劃的株距留足苗數。
3 中耕除草和培土
中耕的時間和深度應根據天氣、土壤墑情和苗情來確定。“芝麻滿月三道草”，一般的在幼苗長出第1對真葉時進行第一次中耕，中耕宜淺不宜深，以除草保墑為主，防止過深傷根；第二次中耕在芝麻長出2～3對真葉時進行，深度5～6cm為宜；第三次中耕宜在5對真葉時進行，深度可達8～10cm。結合最后一次中耕，進行培土封根，以利排水和灌水，以利防除漬害和干旱，以利減少病害，防止倒伏。此外還應做到“雨后必鋤，有草就鋤”，直至盛花期不再進行。
4 防治病蟲
芝麻苗期主要病蟲害有枯萎病、病毒病、立枯病、小地老虎、蚜蟲等，它們可引起缺苗斷壟，影響芝麻生長。可以用2.5%適樂時進行藥劑拌種和3%呋喃丹進行土壤處理，還可以人工捕殺幼蟲、抹去卵塊，及時發現并拔除病株帶出田外銷毀，還可以用50%多菌靈800倍液加48%樂斯本乳油2000倍液進行防治。
