1、降低農作物營養成分含量，從而導致糧食中所含的某一營養成分缺失，這是因為吸收了除草劑的農作物無法合成其應具備的某一營養元素。2、持續使用會導致自然植被遭到不同程度的破壞，一些物種很可能被滅絕。3、除草劑的殘留會危害人畜，使人畜的患病機率嚴重增加。
一、降低農作物營養成分含量，從而導致糧食中所含的某一營養成分缺失
1、農田噴霧“除草劑”之后，除草劑的成分不能全部被雜草吸收，大部分“除草劑”游離存在于土壤中。農作物在成長時吸收養分的過程中，將這些游離存在于土壤中“除草劑”的成分部分吸收，導致農作物桔桿和果實中有一定量的“除草劑”成分蓄積。
2、吸收了“除草劑”的農作物其生物組織會遭到一定程度的破壞，無法合成其應具備的某一營養元素，從而導致作物果實中的某些營養成分缺失。這就是現在糧食中部分營養成分缺乏的最主要原因。
二、持續使用會導致自然植被遭到不同程度的破壞，一些物種很可能被滅絕
在噴施“除草劑”的過程中，由于“除草劑”的揮發和風的作用，使部分“除草劑”成分漂浮于空氣中，從而產生季節性的空氣污染。在農耕季節，走在農田的道路和小路上，一定能聞到刺鼻的氣味。漂浮在空氣中的“除草劑”在風的作用下還會被吹落到很遠的林間山野，這樣就會導致自然植被遭到不同程度的破壞。
三、危害人畜，使人畜的患病機率嚴重增加
由于“除草劑”在植物桔桿、田間菜草和糧食中有一定量的殘留，人、畜在日常生活中必須消耗這些物質，從而致使其“除草劑”成分在人、畜的體內蓄積，少量時并沒有什么現象顯現。當體內積累超量（超過機體承受能力）或機體免疫力下降時，立刻就會發生如同山崩屋塌一樣難以挽救的病變，后果難以挽回。
