多菌靈的使用方法取決于使用對象和病害類型。
麥類：防治黑穗病，可用多菌靈100克兌清水4公斤，稀釋后均勻噴施100公斤麥種，再堆悶6小時左右便可播種。
棉花：防治立枯病和炭疽病，可用多菌靈拌種，藥物用量為500克/100公斤。
油菜：防治菌核病，畝用37.5-62.5克多菌靈兌水50-80公斤，稀釋后再噴霧，花期和終花期可分別噴1次。
一、多菌靈的使用方法
1、使用方法
（1）麥類
①如果是防治黑穗病，使用100g多菌靈（有效成分）兌水4kg稀釋，然后均勻噴灑在100kg麥種上，堆悶6小時左右，或者是每100kg的小麥種子，使用156g多菌靈（有效成分）兌水156kg稀釋，浸種36小時左右。
②如果是防治赤霉病，可以每畝地使用150-200g的25%多菌靈可濕性粉劑兌水50-80kg稀釋噴霧，后續根據病情和天氣狀況，決定在過5-7天是否重復用藥一次（用藥量和首次相同）。
（2）棉花
每100kg的棉花種子使用500g多菌靈（有效成分）進行拌種，或者是每100kg的棉花種子使用250g多菌靈（有效成分）兌水250kg，浸種24小時左右，可以有效防治棉花立枯病和炭疽病。
（3）水稻
①如果是防治葉瘟病，應當在大田中發現有發病中心的時候噴藥進行防治，7天后重復用藥一次。如果是防治稻瘟病，應當在水稻破口期和齊穗期的時候，分別用藥一次。用藥量為37.5-50g（有效成分）/畝。
②如果是防治水稻小粒菌核病，應當在水稻圓稈拔節期至抽穗期的時候，每畝地使用37.5-50g的多菌靈（有效成分）兌水50-80kg稀釋噴霧，每隔5-7天用藥一次，連續用藥2-3次。
③如果是防治水稻紋枯病，應當在水稻分蘗末期和孕穗前分別用藥一次，每畝地的用藥量為37-.5-50g（有效成分），噴灑時，重點噴灑水稻的莖部。
（4）油菜
在油菜的花期和終花期的時候，分別噴藥一次，每畝地每次使用37.5-62.5g多菌靈（有效成分）兌水50-80kg稀釋噴霧，可以有效防治油菜菌核病。
（5）花生
每100kg的花生種子使用500-1000g的50%多菌靈可濕性粉劑進行拌種，或者是將花生種子浸泡24小時過后，再使用500-1000g的50%多菌靈可濕性粉劑進行拌種，可以有效防治花生立枯病、莖腐病和根腐病。
（6）甘薯
播種之前，使用多菌靈20000倍液浸種10分鐘左右，或者是使用30mg/kg的多菌靈藥液浸苗基部3-5分鐘左右，可以有效防治甘薯黑斑病。
（7）番茄
①在早疫病病發初期的時候，每畝地使用31.3-37.5g多菌靈（有效成分）兌水50kg稀釋噴霧，每隔7-10天噴灑一次，連續噴灑3-5次。
②按照種子重量的0.3-0.5%的用量進行拌種，或者是使用50%多菌靈可濕性粉劑500倍液進行灌根，每株的用量為0.3-0.5kg左右，可以防治番茄枯萎病。
③使用50%多菌靈可濕性粉劑600-800倍液進行噴霧，每隔7-10天用藥一次，連續用藥2-3次，可以有效防治西紅柿菌核病和灰霉病。
（8）黃瓜
①使用2kg的25%多菌靈可濕性粉劑和2000kg的土雜肥混合，配制成藥土進行覆蓋，可以有效防治黃瓜炭疽病。
②使用50%多菌靈可濕性粉劑500倍液進行灌根，每株用藥0.3-0.5kg左右（病重地塊在10天后繼續用一次藥），可以有效防治黃瓜枯萎病。
③使用50%多菌靈可濕性粉劑600-800倍液進行噴霧，每隔7-10天用藥一次，連續用藥2-3次，可以有效防治黃瓜灰霉病。
④每畝地使用100-200g的50%多菌靈可濕性粉劑兌水稀釋噴霧，每隔5-7天用藥一次，連續用藥2次，可以有效防治黃瓜白粉病。
⑤使用50%多菌靈可濕性粉劑500倍液進行噴霧，每隔7-10天用藥一次，連續用藥2-3次，可以防治黃瓜菌核病。
（9）梨樹
如果是防治梨黑星病，可以在梨樹萌芽初期的時候，使用25%多菌靈可濕性粉劑250倍液噴灑一次，落花后噴灑第二次，后續根據病情的發展，決定是否繼續噴藥，通常用藥3-4次，間隔時期為7-10天。
（10）桃樹
在桃子套袋之前，使用25%多菌靈可濕性粉劑200-400倍液進行噴霧，每隔7-10天噴灑一次。
（11）蘋果樹
在褐斑病病發初期的時候，使用25%多菌靈可濕性粉劑250-400倍液進行噴霧，每隔7-10天噴灑一次。
（12）葡萄樹
在葡萄展葉后到果實著色前這段時間，使用25%多菌靈可濕性粉劑250-500倍液進行噴霧，每隔10-15天左右噴灑一次，可以有效防治白腐病、黑痘病、炭疽病等。
（13）花卉
可以用于防治大麗花花腐病、月季褐斑病、君子蘭葉斑病、海棠灰斑病、蘭花炭疽病、葉斑病，花卉白粉病等，使用方式為噴灑25%多菌靈可濕性粉劑250倍液，每隔7-10天噴灑一次。
2、注意事項
（1）該藥物不可長期單一使用，也不能和硫菌靈、苯菌靈、甲基硫菌靈等同類藥物輪流交替使用。
（2）不可和強堿性藥劑或者是含銅藥劑混合使用。
（3）蔬菜采收前18天左右，應當停止使用該藥物。
（4）在水稻上的使用安全間隔周期為14天，每季最多使用3次。
二、多菌靈可用于土壤嗎
1、多菌靈可用于土壤，多菌靈是一種針對的劑，可以用來種子、土壤的，而根腐病也是因為導致根部腐爛。多菌靈的組要用處就是葉面噴霧、種子處理和土壤處理。
2、多菌靈常用于為谷物或水果，但在部份國家，這種劑只可用于球場或康樂設施，而不可用于農產品。多菌靈常用于為谷物、柑橘屬、蕉、草莓、鳳梨等水果殺，多菌靈的4.7%氫氯化物水溶液可用于荷蘭榆樹病。
