野生蜈蚣的天敵很多，有蟾蜍、蛙類、鼠類、夜行鳥類、某些爬行類、蟻類等，但在人工養殖尤其是室內養殖的情況下，只有鼠類、蟻類能構成直接威脅，而其他類在室外養殖時才會構成一定威脅。

(一)鼠類

在蜈蚣大量外出活動的夜間，如果有一只老鼠竄入正在覓食的蜈蚣群中，則會發生一場“遭遇戰”，此時老鼠不一定能取勝，往往會落荒而逃或成為蜈蚣聚餐的佳肴。但是，如果蜈蚣處于蛻皮期或處于冬眠期，此時老鼠竄入養殖池鉆入飼養土中則會吃食大量蜈蚣，造成巨大的損失。因此，鼠害是蜈蚣的第一大危害，防除鼠害主要做好以下工作：

(1)養殖舍的門窗，不得有破損，墻壁不得有與外界相通的磚洞，如發現門窗破損或有磚洞及根邊有地洞，應立即檢查室內是否已竄入老鼠，同時補好這些破損與洞口，門與墻壁、地面之間的縫隙要小，不得能容納老鼠拱入，人離開飼養舍時應隨手把門關嚴，窗戶應安裝防鼠網。

(2)飼養舍不得堆放家什、雜物、不給老鼠藏身之處，以便偶然老鼠闖入時能及時發現。

(3)有條件時，最好在每個飼養池上加蓋防鼠鐵絲網，以防從屋頂竄入的老鼠進入飼養池中。

(4)發現飼養舍內有老鼠應及時捕殺。

(二)螞蟻

少量的螞蟻與健壯的蜈蚣遭遇時，它們會避而遠之，但當蜈蚣蛻皮時或孵出的幼小蜈蚣，則常常成為大群螞蟻的攻擊對象，螞蟻攻擊蜈蚣時，先是少量的螞蟻用它們的上顎鉗住蜈蚣的步足,使其行動不方便,然后大群螞蟻群一起爬向蜈蚣身上較軟的皮膚處,將蜈蚣叮咬致死.蜈蚣卵更是螞蟻向往的美味佳肴,因此,處于孵化中的雌蜈蚣是螞蟻的主攻對象,而此時的雌蜈蚣又常常因體力衰竭而處于半冬眠狀態,這使螞蟻更易得逞.因此,孵化池更需防止螞蟻侵入.防止螞蟻危害,主要從以下幾個方面著手:

(1)飼養室周圍以及室內走廊要經常清掃,保持清潔衛生,攜帶飼料或其他物品進出時應仔細,不得在地上遺留螞蟻喜食的汁液或餌料動物尸體、飼料等,以免逗引螞蟻.

(2)在飼養池的池外四周或池內沿池壁墻腳四周建一圈水溝，溝內經常性灌滿水，這樣既可防止蜈蚣外逃，也可防止螞蟻爬入養殖池內。

(3)添加或更換飼養土時，新進入池中的飼養土不得有螞蟻或蟻卵存在，一是要選擇無螞蟻活動的區域的泥土制作飼養土地老天荒是如果懷疑飼養土被螞蟻或蟻卵污染，可將飼養土放于火中烤干，再用清水調節含水量。

(4)平常要仔細檢查飼養舍或池內是否已有螞蟻侵入，一旦發現螞蟻侵入，則應立即消滅。消滅螞蟻可采用下述方法：

①對于飼養舍內、飼養池外螞蟻窩，可用3%的氯丹粉撒入蟻窩及其周圍，殺死螞蟻。

②對于飼養池內螞蟻可用食物誘殺，螞蟻特愛甜食、蒸煮過的骨頭等，可將這樣物品，白天堆放于飼養池內，并點投放，每2——3小時處理一次，往往可以大量誘殺螞蟻。

③蜂蜜、硼砂、甘水、水按1：1：1：10的比例攪拌均勻，用微火加熱熔化，放于紙上，投入飼養池內的活動場中，也可大量誘殺螞蟻。

④生石灰、植物油、鋸木屑，按1：1：5的比例攪拌均勻，圍繞飼養池周圍撒一圈，可以防止螞蟻進入池內。

除上述鼠類與螞蟻外，雞也會危害蜈蚣，雞若進入飼養池，會扒開飼養土啄食蜈蚣，因此也應防止它們竄入。