螞蟻的生命力很強，疾病較少。澳大利亞克利大學的貝蒂教授經多年研究，發現螞蟻的分泌物中含有抗生素，可抑制多種病菌、病毒的生長、擴散。雖然螞蟻很少感染病毒，但不意味著不會生病，特別是在密集性的飼養環境下，更不能忽視疾病的防治工作。如果某種病菌、病毒一旦發生并蔓延，輕者會造成蟻群數量下降，減產；重者會造成大量死亡，甚至導致全軍覆滅。

目前對螞蟻病蟲害的研究還欠深入，防治工作以預防為主，一旦發現病源及時地毫不留情地徹底焚燒處理。螞蟻病蟲害的防治措施很多，主要是從源頭杜絕和控制在萌芽時，具體如下：

1.種巢進場消毒

為了有效防治病蟲害和提高飼養效益，工廠化飼養要實行同進同出，即在同一飼養室，要同時接入新巢，同時淘汰老巢。在接后前20天，要對飼養室、蟻巢、養蟻架進行全面徹底的清潔消毒。

2.清潔衛生

經常保持蟻場、飼養室、養蟻架、蟻島、蟻巢的清潔衛生。工作人員要注意個人衛生。飼養室外的場地、通道、下水道、水池等要定期清掃消毒。不要用帶病菌、病毒和變質的飼料，對水源要經常消毒。發現有發霉變質的蟻土、蟻巢、蟻島土坯應立即更換，從養蟻架清除的廢物要集中焚毀或深埋。

3.檢疫

定期抽檢螞蟻送交有關檢疫部門檢驗，如發現問題要及時處理。

4.治療

通過對蟻糞、個體、蟻群的細心觀察，發現異象，送交檢驗部門檢查確診后，要及時對癥下藥。同時還要與相應的飼養管理相配合。在要選用合適的藥物和劑量時，必須考慮到是否會對以后的螞蟻成品造成污染，避免帶來更大的經濟損失。常見疾病如下：

(1)傷寒病 癥狀為體質衰弱，個體重量下降，糞便鉆稠，不成粒。多因寒潮入侵所引起。要注意加溫保暖，在食物中加復方新諾明或氯霉素，一般用量為飼料重量的0.2%，可根據病情適當增減。

(2)寄生螨 蟻島濕度過高，殘食變質，養蟻架霉變等，都可能引起蜻類大量發生。發生量小時，及時降低濕度，并鏟除蟻島、蟻巢的表土，更換新蟻土。盡量少用藥物殺滅。

(3)天敵 螞蟻的天敵很多，如蚌蟒x蜘蛛、斑鰲、椿象、蟻獅、蠑螈、蟾蛛、刺渭、穿山甲
犬類等，它們都會直接食用螞蟻，要經常做好防患措。要注意預防天敵為害，如發現天敵侵入為害及時用人工捕捉天敵，清除為害。