1.水溫與攝食自然界野生鱷龜的攝食強度存在著明顯的季節變化：夏秋季強烈攝食，冬春季攝食減少甚至停食。鱷龜攝食強度的季節性變化完全受水溫的影響。鱷龜在水溫18 ℃ 時開始攝食，隨著水溫逐步升高，攝食強度也逐漸增大，30 ℃ 時，攝食量最大，當水溫超過30 ℃ 后，攝食量反而有所下降，34 ℃ 以上停止攝食，出現“伏暑”現象。在人工控溫條件下，鱷龜的攝食強度無明顯季節變化，可一直保持在較高的攝食水平。
2.水溫與生長鱷龜是變溫動物，它的生長與水溫高低有著密切的關系，水溫一方面影響鱷龜的餌料生物在自然界出現的時間和豐度，另一方面影響鱷龜的代謝強度。鱷龜的生長水溫為20-33 ℃ ，最適水溫為28-31 ℃ 。在20-30 ℃ 的適溫范圍，水溫越高，對鱷龜的生活越有利。具體表現為隨著溫度的上升，鱷龜的攝食活動越活躍，代謝越旺盛，生長速度也越快。當水溫超過42 ℃ 或低于-5 ℃ ，則會引起鱷龜的死亡。一年中，自然界大多數地區的水溫對養殖鱷龜來說是偏低的，餌料生物大量出現的時間較短，因而鱷龜的肥育季節也很短暫，但生活在平均氣溫偏高地區水域中的鱷龜，體重增長就相應快些。水溫對鱷龜餌料營養物質吸收轉換效率的影響和對鱷龜攝食量的影響有相類似的規律，在一定溫度范圍內，隨溫度升高而升高，而鱷龜的生長快慢與鱷龜攝食量和對餌料物質的吸收轉換效率呈直線相關。工廠化養殖鱷龜就是利用這一點，采用控溫措施使鱷龜的攝食量和轉換效率處于理想值，顯著促進鱷龜的生長。從而在12 個月左右的時間內( 8-15 個月），使養殖鱷龜體重達到1-1. 5 千克的商品鱷龜規格，而這一體重在常溫條件下一般需3-4 年才能達到。
當然，也必須注意到，在人工控溫條件下，鱷龜因習慣于高溫條件下攝食生活，其攝食的水溫范圍與野生鱷龜產生了差異，變得比較狹窄。有時室內水溫變化1-2 ℃ ，即會明顯地影響鱷龜對食物的攝食利用，導致1 ℃ 的溫度差可使日增重率相差近1 倍，因此，保持水溫的相對穩定，是工廠化養殖鱷龜日常管理最重要的工作之一。
3.氣溫、水溫與繁殖年平均氣溫和水溫的高低直接影響著鱷龜的性成熟時間，通常高溫地區生長期長，鱷龜性成熟相應較早；低溫地區生長期短，鱷龜性成熟也較晚。如在我國臺灣省南部及海南島，鱷龜一般2-3 年即可達到性成熟，華南地區需3-4 年，華中地區需4-5 年，華北、東北地區則需6 年或更長時間。工廠化養殖在人工控溫條件下，保持池水溫度在30 ℃ 左右，1-2 年即可使養殖鱷龜達到性成熟。
水溫的變化還決定著鱷龜產卵活動的開始和終結時間。若春季水溫回升提早或延后，則產卵期也相應變動。在長江流域，氣溫達到20 ℃ 以上，親鱷龜蘇醒后即開始發情交配，隨著水溫進一步上升，5 月中下旬開始產卵，7 月下旬后停止產卵。6 月是鱷龜產卵的旺季，此期間的產卵量一般占全年產卵總量的80 ％以上。
當鱷龜卵在陸地沙土中孵化時，沙土溫度將直接決定著胚胎發育的進程。鱷龜卵在孵化過程中能夠適應22-36 ℃ 的溫度范圍，最適溫度是30 -32 ℃ ，低于22 ℃ 時胚胎發育停止，高于38 ℃ 時會致死胚胎。鱷龜卵在孵化過程中，對溫度變化極為敏感，變動1 ℃ 就可顯著地影響胚胎發育的速度。
鱷龜卵的孵化率與孵化時間也密切相關。在孵化適溫范圍內，孵化時間越長，孵化率越低。在自然條件下，因溫度的波動范圍較大，加上其他生態條件的劇烈變化，如砂土的含水量、粒度粗細等不穩定，致使鱷龜卵孵化率極低，僅30 ％左右。適宜的孵化溫度是提高鱷龜卵孵化率，縮短胚胎發育時間的關鍵。工廠化鱷龜養殖場，利用孵化室采取人工控溫、控濕及適時通風換氣等技術措施，使鱷龜卵的孵化在理想的生態條件下進行，孵化率一般可達90 ％以上。
4.鱷龜對氣溫、水溫變化的適應野生鱷龜對溫度變化的適應力較強，屬于廣溫性動物，能忍受的最低極限溫度為-5 ℃ ，最高水溫為42 ℃ ，但適宜的水溫僅為20-33 ℃ 。每年從10 月至次年4 月，當水溫降至15 ℃ 以下時，鱷龜即潛入水底進行“冬眠”，冬眠期間體重減輕10 ％-15 % ，冬眠是鱷龜對不良環境的一種保護性適應。在工廠化養殖鱷龜的人工加溫池，鱷龜的冬眠習性被打破，可以不進行冬眠而正常的攝食生長。如果溫度太高，鱷龜也怕熱，當水溫超過34 ℃ 時，鱷龜就會尋找涼爽之處，伏暑納涼并停止攝食。水溫的急劇變化對鱷龜的正常生活非常不利。實踐表明，鱷龜一般不能忍受5 ℃ 以上的溫差，否則極易造成鱷龜的死亡，幼鱷龜比成鱷龜尤為敏感。在人工控溫養殖條件下，日常養殖工作如洗池換水、分池轉池等操作過程中，易使水溫的溫差變化過大，因而要特別注意。
溫室養鱷龜往往過多地強調水溫的恒定性，這是否有利于鱷龜的生長還值得進一步研究。因為在自然界中，正常受溫度季節變化影響的生物，比如大多數溫帶地區生物，在恒溫條件下生理機能容易受到壓抑，從而導致生命活動力降低，免疫力下降。近年來工廠化養殖鱷龜病害的日趨嚴重，可能與此有一定關系。
氣溫多變或氣溫與水溫溫差較大，對鱷龜的生長也極為不利，不少鱷龜養殖戶在冬季采用土爐加溫養殖，池水溫度較高，而氣溫卻未能同步上升，差異可達12 ℃ ，這種不協調的溫度環境，對于用肺呼吸的鱷龜的健康養殖也極為不利。因此，人工控溫時溫室水溫和氣溫的同步調溫也非常重要。