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綿羊KAP6基因家族四個新基因的鑒定

KAP6是一個高甘氨酸-酪氨酸角蛋白相關(guān)蛋白(HGT-KAP)家族。研究認(rèn)為該家族包含多個基因。在這項研究中,研究人員利用KRTAP6編碼序列搜索綿羊基因組(v3.1)并確定了五個同源區(qū)(R1-R5)。這些區(qū)域包含一個開放閱讀框,他們的綿羊皮膚表達(dá)序列標(biāo)簽(EST)要么是相同的,要么是高度相似的。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,不同物種KAP6序列的R1-R5進(jìn)行聚類結(jié)果與其他HGT-KAPs不同。R1與KRTAP6-1序列的特征非常相似,但剩余的基因是新產(chǎn)生的。

通過設(shè)計PCR引物并擴(kuò)增證實了這些新基因的存在。對所研究的96只綿羊全部進(jìn)行了擴(kuò)增。6、5、3和6的PCR-SSCP模式代表6、5、3和6的DNA序列分別在KRTAP6-2至KRTAP6-5基因中觀察到。KRTAP6-2 和KRTAP6-4分別有5個和3個SNPs。KRTAP6-3中檢測到3個SNPs和一個45bp的插入/缺失,KRTAP6-5中檢測到5個SNPs和18bp的插入/缺失。美利奴羊和羅姆尼羊間這些KAP6基因的等位基因頻率是不同的。

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