臺灣泥鰍是雜食性魚類，飼料和肥料來源廣。動物性飼料有蠶蛹、蚯蚓、螺螄、河蚌、小魚及動物內臟等；植物性飼料有米糠、麥麩、豆渣、豆餅以及其他農產品加工廢棄物；還有水生的天然餌料，如水蚤、絲蚯蚓、小昆蟲等。小規模養鰍，可在附近的大水面比如湖泊、水庫、河溝撈取。
無論采用哪一種飼養方法飼養臺灣泥鰍，都離不開日常管理工作。
一、投餌施肥
1．餌料和肥料的種類
臺灣泥鰍是雜食性魚類，飼料和肥料來源廣。動物性飼料有蠶蛹、蚯蚓、螺螄、河蚌、小魚及動物內臟等；植物性飼料有米糠、麥麩、豆渣、豆餅以及其他農產品加工廢棄物；還有水生的天然餌料，如水蚤、絲蚯蚓、小昆蟲等。小規模養鰍，可在附近的大水面比如湖泊、水庫、河溝撈取。若是較大規模養殖臺灣泥鰍，可自己利用田邊地角培育活餌料。
2．施肥投餌
與飼養其它魚類一樣，施肥的主要目的，也是為了培養水中的浮游生物，以作臺灣泥鰍天然餌料。肥料主要有人畜糞便(有機肥料)或化肥(無機肥料)。投餌主要是人工制作的配合料。另外，據養鰍者反映，蠶蛹是臺灣泥鰍最理想的食物，用蠶蛹養出的臺灣泥鰍，個體肥短、肉厚、含脂量高、骨胳較軟、食用價值高。可購蠶蛹，再輔以其它餌料，具體要根據臺灣泥鰍的需要配以其它適宜餌料。在漁一畜一農綜合經營措施中結合來養臺灣泥鰍，可多渠道自給自足地解決餌料和肥料問題。
3．投餌施肥的方法
投餌是將餌料與腐植土混合成粘性團狀進行投喂，餌料投在固定的食場。要注意不同生長階段和不同水溫時，臺灣泥鰍對餌料的不同要求，以調整餌料的種類及投喂量。水溫在20℃以下時，植物性餌料約占60％～70％，動物性餌料占30％～40％；水溫20℃以上時，逐漸調整為以動物性餌料為主。具體是：水溫在20～24℃，動物和植物性餌料各占50％；水溫25～27℃時，動物性餌料調到60％～70％，植物性餌料降到30％～40％；水溫在28～30℃時動物性餌料又降到50％或更低。投餌量也要隨著水溫的變化而調整，一般每天投餌量為：3月份，投餌量為臺灣泥鰍總重的1％～2％；4-6月份，投餌量為臺灣泥鰍總重的3％～5％；7-8月份，投餌量可增加至臺灣泥鰍總重的10％～15％；到9月份，投餌量則逐漸下降至臺灣泥鰍總重的4％。當水溫高于30℃或低于IO℃時要減少投餌量或不再投餌。水溫適宜時每天分早、中、晚投喂三次，讓臺灣泥鰍“少吃多餐”，水溫較低時每天只分上下午投喂二次。
施肥要根據水體中的餌料生物的豐欠情況來決定，餌料生物少時，在池水邊角處施堆肥。操作方法參照堆肥培育法。
二、防逃、防缺氧
遇梅雨季節或暴風雨，要做好防汛防洪工作。要檢查防逃設施的安全，進出水口的柵欄是否通暢。防止臺灣泥鰍在溢水時逃跑或從漏洞逃跑。夏季高溫陰雨天要注意防止臺灣泥鰍浮頭，特別是靜水養殖，要不時加注新水，若發現浮頭，應及時加注新水或采取增氧措施。
三、水質管理
靜水飼養臺灣泥鰍，水質要清新。水質以黃綠色為好，透明度20～25cm；當水色開始變成茶褐色或黑褐色時，必需換水，以免夜間溶氧不足。流水養臺灣泥鰍時，以微流水為主，流速、流量均不宜過大，水流過大過急，不僅使餌、肥流失，最不利的是使臺灣泥鰍體能消耗過大，增重較慢。
四、消毒防病
養殖用的水體在放養臺灣泥鰍種苗以前，要嚴格用生石灰清塘消毒。在日常養殖管理中，要將食臺上的殘餌及池中的死亡個體撈出，以防水質惡化和疾病傳染。在發病季節，應定期用生石灰按每平方米30～50g的量，化水潑灑。
五、防止敵害
在飼養地四周清除害獸易潛伏之地，并撒上殺鼠劑或安放捕鼠器具；要有驅趕鳥獸的設備；同時防止野雜魚，特別是肉食性魚類進入池內。
六、臺灣泥鰍的越冬管理
臺灣泥鰍對水溫的變化相當敏感，除我國南方終年水溫不低于15℃地區，可常年飼養臺灣泥鰍不必考慮低溫越冬措施以外，其他地區一年中臺灣泥鰍的飼養期7～8個月不等，有2～5個月的低溫越冬期。此間需做好以下工作：
1.挑選體質健壯、無疾病的臺灣泥鰍作為留種親鰍，越冬時成活率高。
2.越冬池先要用生石灰消毒，后撒入適量農家肥料，鋪上20～30cm的軟泥。泥以上有lO～20cm凈水深。在結冰地區，冰下水深需加深至20～30cm。水溫要保持在2℃以上。
3．稻田臺灣泥鰍越冬，將臺灣泥鰍集中于魚溜中，并在魚溜里鋪設和加蓋稻草，讓臺灣泥鰍鉆進魚溜底部淤泥和稻草中避寒。
4．越冬池放養的臺灣泥鰍密度，高于飼養密度的2～3倍。
5．采用人工設置越冬箱的方法，效果很好；越冬箱為木質材料，其規格為lOOcm x30cm×20cm，每只箱放6～7kg臺灣泥鰍。裝箱方法是：箱底鋪上3cm左右厚度的細土，再裝2kg臺灣泥鰍。后又裝好3cm厚的細土，再裝2kg臺灣泥鰍。如此三層，最后裝滿細土。細土在用前拌好適量的農家肥料。釘好箱蓋，并在箱蓋上打若干個洞，在背風向陽的水面沉入水底即可。
6．越冬的臺灣泥鰍，除了要有好體質外，還需要一個良好的環境條件。因此，對越冬場所要進行修整，清除污染雜質，特別對食場更要進行重點清理，以防殘渣分解，消耗氧氣，放出有害氣體。越冬的場地要預先進行消毒，或經太陽曝曬，并做好注排水口的加固工作，以免逃魚。在氣候暖和的地方，越冬池可在食場的基礎上加深30cm以上。
7．越冬池應保持較高的水位，一般在2m左右。在越冬期間，要經常測定池底泥土溫度，如果泥土溫度接近5℃，就要引進溫度較高的地下水或采取其他有效措施，使水溫升高，保持池水溫度在5～6℃以上。
8．稻田臺灣泥鰍越冬。要將臺灣泥鰍集中于魚溜中，并在魚溜里鋪設和加蓋稻草，讓臺灣泥鰍鉆進魚溜底部淤泥和稻草中避寒。
