常見的有早疫病、晚疫病、灰霉病、葉霉病、枯萎病等。
早疫病：發病時，下部葉片出現水漬狀暗褐色小點，后逐漸擴大成圓形病斑，病斑上帶有深褐色同心輪紋，空氣潮濕時病斑上會長出黑霉。
晚疫病：發病初期，幼苗的葉片上出現水浸狀病斑，病斑向主莖蔓延后莖基部會變細，呈水漬狀縊縮。
灰霉病：發病時，莖部出現水浸狀小點，后擴展為長圓形病斑，濕度較大時會出現灰色霉層。
一、西紅柿早疫病
1、發病癥狀
（1）葉片發病：多從下部葉片開始，初為水漬狀暗褐色小點，后逐漸擴大至圓形或橢圓形病斑，外緣有黃色或黃綠色暈環，病斑上有深褐色同心輪紋。空氣潮濕時病斑上生出黑色霉層，嚴重時葉片上出現大量病斑，可使病葉卷曲、干枯、早落。
（2）莖部發病：病斑多發生在分枝處，病斑呈橢圓形，灰褐色，稍凹陷。
（3）果實發病：多從果蒂附近有裂縫處發生，病斑呈褐色或暗黑色，稍凹陷，上生黑霉，病果易開裂。
2、防治方法
（1）病重地塊與茄科蔬菜實行3年以上的輪作。
（2）種植抗病品種，比如中蔬6號、佳粉2號、中雜105、中研958等。
（3）發病初期，噴施75%百菌清可濕性粉劑600倍液，或50%撲海因可濕性粉劑1000倍液，或50%多菌靈可濕性粉劑1500倍液，或75%代森錳鋅可濕性粉劑500倍液，或64%殺菌礬可濕性粉劑400倍液，每畝地每次噴施60公斤藥液，連續噴施2-3次。
二、西紅柿晚疫病
1、發病癥狀
（1）幼苗：發病初期，葉片上出現暗綠色水浸狀病斑，并逐漸向主莖蔓延，導致莖基部變細，呈水漬狀縊縮，最后整株萎蔫或折倒，濕度大時病部表面著生白色霉層。
（2）莖稈：病部初呈水漬狀，后逐漸呈暗褐色或黑褐色腐敗狀，病莖部組織變軟，水分供應受阻，嚴重時病部會折斷，植株萎蔫。
2、防治方法
（1）幼苗發病時，可在發病初期噴施72.2%普力克水劑800倍液，或40%甲霜銅可濕性粉劑，或72%克露可濕性粉劑400-600倍液，或64%殺毒礬可濕性粉劑500倍液，每隔7-10天噴1次，連續噴施4-5次。
（2）莖稈發病時，可在病部涂抹56%嘧菌酯百菌清1000倍液，或50%甲基托布津可濕性粉劑200倍液，每隔7-8天涂抹1次，連續涂抹2-3次。
三、西紅柿灰霉病
1、發病癥狀
（1）莖部發病：初呈水浸狀小點，后擴展為長圓形（或不規則形）淺褐色病斑，濕度較大時病斑表面會出現灰色霉層，嚴重時致病部以上莖葉枯死。
（2）葉片發病：一般從葉尖部開始發生，病斑沿支脈間呈“V”形向內擴展，初呈水浸狀，展開后為黃褐色，邊緣不規則、深淺相間的輪紋，表面生少量灰白色霉層。
（3）果實發病：殘留的柱頭或花瓣多先被侵染，后向果實或果柄擴展，致使果皮呈灰白色，并生有厚厚的灰白霉層，呈水腐狀。
2、防治方法
（1）定植前，對植株噴施50%多菌靈可濕性粉劑500倍液，或50%速克靈可濕性粉劑500倍液噴霧，以減少病原菌的數量。
（2）發病初期，噴施50%速克靈活可濕性粉劑2000倍液，或50%多菌靈可濕性粉劑500倍液，或50%撲海因可濕性粉劑1500倍液，每隔7-10天噴1次，連續噴施2-3次。
四、西紅柿葉霉病
1、發病癥狀
發病初期，葉片的背面出現不規則的褪綠斑，隨著病情的發展，病斑處會生出灰褐色絨狀霉層，葉片的正面在相應的部位還會褪綠變黃，濕度較大時，病葉正面也會長出灰褐色的霉層。
2、防治方法
發病初期，交替噴施25%嘧菌胺懸浮劑900倍液、25%甲硫·腈菌唑500-800倍液、30%醚菌酯懸浮劑2500倍液、50%異菌脲懸浮劑1500倍液，每隔7天噴1次。
五、西紅柿枯萎病
1、發病癥狀
（1）主要危害西紅柿的根部，根莖染病時，植株的葉片在中午呈萎蔫下垂狀，早晚又會恢復正常，同時葉色會變淡，似缺水狀，反復數天后，逐漸遍及整株葉片婁蔫下垂，葉片不再復原，最后全株枯死。
（2）橫剖病莖時，可發現病部的維管束變為褐色，另有癥狀表現為發病株一般在莖的中下部出現較多的不定氣生根。
（3）田間濕度高時，在枯死株的莖基部常有粉紅色霉層產生，即病菌的分生孢子梗和分生孢子。病程進展較慢，病株往往要經過15-30天才會枯死，發病期間病部不會流出乳白色粘液。
2、防治方法
（1）發病前，用90%多菌靈500-600倍液或50%烯酰嗎啉1000-1500倍液進行灌根，每棵植株可澆灌0.25公斤藥液，每隔10天灌1次，連灌2-3次。
（2）發病初期，噴施50%托布津可濕性粉劑500倍液，或50%多菌靈可濕性粉劑500-1000倍液，每隔7-10天噴1次，連續噴施3-5次。
