雜交水稻三系法分別為雄性不育系、保持系、恢復系。
雄性不育系：是一種雄性退化、雌蕊正常的母水稻，花粉無活力，無法自花授粉及結實，只能依靠外來花粉受精結實。
保持系：屬于正常的水稻品種，但將它的花粉授給不育系之后所產生的后代仍為不育系。
恢復系：屬于正常的水稻品種，將其花粉授給不育系后，產生的雄性雜交種可以自交結實。
一、雜交水稻三系法介紹
1、雄性不育系
雄性不育系是一種雄性退化（主要是花粉退化）但雌蕊正常的母水稻，由于花粉沒有活力，無法自花授粉和結實，只能依靠外來的花粉才可以受精結實，所以借助這種母水稻（雄性不育系）作為遺傳工具，并進行人工輔助授粉即可生產出大量的雜交種子。
2、保持系
保持系屬于正常的水稻品種，但用它的花粉授給不育系之后所產生的后代依然為雄性不育系，因此借助保持系就能讓不育系持續繁殖，若失去保持系，不育系便會絕種。
3、恢復系
恢復系也屬于正常的水稻品種，但將它的花粉授給不育系后，所產生的雜交種雄性能恢復正常，可進行自交結實。如果該雜交種具有優勢，還可以用來生產。
二、雜交水稻三系法的培育原理
1、水稻三系育種是利用核質互作雄性不育性。核基因R為可育，r為不育；細胞質基因N為可育，S為不育；當核基因和胞質基因同為隱性時，才會導致雄性不育。因此不育系（A）基因型為S（rr）；恢復系（R）的基因型為N（RR）或S（RR）；保持系（B）是不育系的同核異質體，基因型為N（rr）。
2、制種時，保持系和恢復系可進行自交繁殖，不育系通過保持系的授粉來繁殖，而恢復系給不育系授粉后可得到F1代水稻，即為雜交水稻。
3、要利用水稻的雜種優勢，就一定要做到三系配套，不育系為大量生產雜交種子提供了可能性，借助保持系來繁殖不育系，讓恢復系為不育系授粉來生產雄性恢復系且具有優勢的雜交種。
