根據花椒樹生長周期的不同時段，一般將花椒樹修剪分為春剪、夏剪、秋剪。
也可以說是生發期修剪、采摘前修剪、采摘后修剪；還可說成是采光修剪、采摘修剪和整形修剪。
一、春剪
春天的三、四月份，是花椒枝葉生發的旺季。此時，只要適宜生長、發育的地方，都會有嫩芽、新枝欣欣然生發出來。
莖、枝、斷折處，處處都會成為萌芽抽枝的好所在，以致整棵植株都進入瘋狂的生發狀態，貌似欣欣向榮的樣子！
然而，此時的花椒樹并不需要過多的萌芽、抽枝，而是需要整枝修剪的。
不僅要及時剪去莖枝上不必要的嫩芽和新枝，減少水肥和營養的消耗，還要大膽剪去已生成的病枝、弱枝、密生枝和交叉枝，以利通風和采光。
如此，既可減少病蟲害的發生，又可使植株受光均勻，促進光合作用，使莖枝生長健壯，為之后的花芽分化和坐果打下基礎。
二、夏剪
花椒的成熟期多在每年的7一10月。其中，又尤以八九月份采摘最宜。此時的花椒果殼開裂、籽黑皮紅、香濃味麻，非常喜人。人們看好晴朗的日子，即會大批量采摘。
然而，花椒因莖枝多尖刺，采摘起來非常不便。人們為此常常會在大批量采摘前來一次大修剪。
先是剪去那些擋住去路，不便深入采摘的行間交叉枝條。再剪去那些掛果少、搶占空間的枝條。最后剪去密生枝和干枯枝。
如此，花椒穗的采、剪都方便了很多，人也不易受到傷害了。
三、秋剪
花椒采摘一般于十月上旬結束。采摘后的花椒樹或多或少都有些凌亂，給人樹容不整的感覺。待其恢復一、兩周，即可進行秋剪。
秋剪主要遵循開心株形、上疏下密、方便采光和采摘為原則。同時，剪去枯枝、病弱枝、受傷枝、交叉枝、密生枝和過高、過長枝條。
如此，既使樹形整潔，枝條疏密有致，還利于植株的營養蓄積。
