調節水質：em菌可以有效降低水體中的亞硝酸鹽以及氨氮含量，同時能夠保持水體清爽、不臭不腐。
提高免疫能力、促進生長：em菌可以增強水產動物腸道消化酶的活性，從而加快營養物質的消化與吸收，促進水產動物生長，同時還能刺激水產動物產生干擾素，增強免疫能力。
培餌：em菌能增加水體有益藻類和浮游動物數量。
一、調節水質
1、em菌加入水體中后快速生長繁殖，形成優勢種群，從而快速分解水產動物的排泄物以及殘余餌料，能夠有效降低水體中的亞硝酸鹽以及氨氮含量。
2、em菌分解有機物后的產物為浮游植物生長提供養分，而浮游植物進行光合作用，又可以提高水體氧氣溶解量，進而優化水質，形成一個良性的生態循環。
二、提高免疫能力、促進生長
1、em菌能夠促進水產動物腸道中有益菌的生長繁殖，調節腸道內的菌群平衡，增強水產動物腸道消化酶的活性，從而加快營養物質的消化與吸收，增強水產動物的抗病、抗應激能力，同時促進水產動物生長，明顯提高增重率。除此之外，em菌還能抑制病原微生物以及有害藻類的繁殖。
2、em菌能夠刺激水產動物產生干擾素，從而提高巨噬細胞活性以及免疫球蛋白濃度，進而增強機體體液免疫以及細胞免疫功能。
3、使用EM菌原液可使蟹苗的成活率提高近一倍，中華石斑魚的成活率也從原來的30%提高到70%以上。
4、使用EM菌原液后，上市時間可提前10-15天左右，平均畝產提高20-35%，產卵量增加25%。
三、培餌
em菌能夠增加水體中的有益藻類以及浮游動物數量，尤其是紅蟲、輪蟲數量明顯增加。
