1、科屬區別：土茯苓是多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核，茯苓是百合科植物攀援植物光葉菝葜的干燥根莖。2、藥性區別：土茯苓主要在于“解毒”二字，茯苓主要在于“寧神”二字。3、功效區別：土茯苓有解毒、除濕、通利關節等功效，茯苓有利水滲濕、健脾、寧心等功效。
一、科屬區別
1、土茯苓：是一種多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核，雖一字之差，但沒有任何關系。
2、茯苓：是一種百合科植物攀援植物光葉菝葜的干燥根莖，在中醫學上屬于兩種不同的藥材。
二、藥性區別
1、土茯苓：主要可以用來“解毒”，如飲食不當，或者由于感染，皮膚出現了是真等，就可以用土茯苓進行解毒。
2、茯苓：主要可以用來“寧神”，如遇春困或是長時間疲勞等，還有失眠，就可以用茯苓調理。
三、功效區別
1、土茯苓
（1）可以解毒、除濕、通利關節等，主要對梅毒及汞中毒、筋骨疼痛、帶下、癰腫、瘰疬、疥癬等癥有效。
（2）同時內服還有促進睡眠、延年健智的作用，或者內服能祛斑美容，外用可以作為面膜使用。
2、茯苓
（1）可以利水滲濕、健脾、寧心等，主要對水腫尿少、痰飲眩悸、脾虛食少、便溏泄瀉、心神不安等有效。
（2）對身體的水腫和小便困難有很好療效，還含有豐富的抗癌物質，還有養心安神以及治療咳嗽的作用。
