1、豚鼠艾美爾球蟲：地克珠利，廣譜苯丙類抗球蟲藥，每百公斤飼料混合1/公斤珠利預混劑100克氯苯胍，每百公斤飼料混合15克。2、治療豚鼠球蟲病時，可使用1/公斤克珠利預混合劑，每100公斤飼料混合400-500克，在藥物預防豬鼠球蟲病時，在飼料中也要增加藥物的量。3、有鉤副盾皮線蟲：動物內外殺蟲王混合飼養。
一、豚鼠艾美爾球蟲
1、這種球蟲是寄生于豚鼠的唯一艾美爾球蟲，容易在幼鼠中流行。感染豚鼠腹瀉，甚至死亡。剖檢可見腸炎、腸出血、盲腸粘膜增厚、斑狀出血點和含蟲體白斑。缺乏維生素C，長途運輸等因素可誘發本病。
2、治療方法：
（1）地克珠利，廣譜苯丙類抗球蟲藥，每百公斤飼料混合1/公斤珠利預混劑100克氯苯胍，每百公斤飼料混合15克。以上兩種藥物交替，地克珠利使用7-8個月后，更換氯苯胍使用4-5個月。上述藥物也可用于治療，一般用預防劑量的2-3倍。治療豚鼠球蟲病時，可使用1/公斤克珠利預混合劑，每100公斤飼料混合400-500克，撤出其他飼料和飼草，連續使用藥物2-3天，控制發病后改為正常預防量。
（2）值得注意的是，飼養豚鼠既喂食又喂的話，在藥物預防豬鼠球蟲病的時候，在飼料中也要增加藥物的量。不那樣的話，使用抗球藥的話，豬鼠會發生球蟲病。在眾多抗球蟲藥物中，含有馬杜霉素的各種劑型藥物不能用于豚鼠，否則會中毒死亡。
二、有鉤副盾皮線蟲
1、是豚鼠常見的蠕蟲。蟲體寄生于盲腸和結腸。雞蛋呈卵圓形，殼體厚，有蛋白膜。豚鼠通過吞感染性卵而感染，卵經60天左右發育成蟲，其生活史為直接型，無復雜的體內移動過程。 感染豚鼠消瘦，無特異性癥狀。檢查并確定蟲體和卵子可以確定這種疾病。 豚鼠體內寄生蟲的預防應做好飼料和墊料的消毒工作，防止飼養用具、飼料和墊料的污染。
2、治療方法：動物內外殺蟲王混合飼養即可解決。
