可以從外形、生長周期、繁殖季節特征、年齡和個體差別等方面辨別黃鱔的雌雄。雌性頭部細小不隆起，背部是青褐色，沒有斑紋花點；雄性頭部較雌性大，稍隆起。一般兩齡以內的都是雌鱔，三齡以上的一般都是雄鱔。黃鱔體長24厘米以下的均為雌性；體長24-30厘米的，雄性占5.2％；體長50厘米以上的全為雄性。
一、外形
1、雌性黃鱔頭部細小不隆起，背部為青褐色，無斑點，有時可見3條平行的褐色素斑，身體兩側從上到下顏色逐漸變淺，褐色斑點細密而且分布均勻。腹部呈淺黃色或者淡青色，腹部肌肉較薄。
2、雌性黃鱔頭部較大，稍隆起。背部一般由褐色斑點形成3條平等的帶狀紋，身體兩側沿中線分別可見一行色素帶，其余的色素斑點均勻分布。腹部呈土黃色，個體大的呈桔紅色，腹部朝上，膨脹不明顯。
二、生長周期
黃鱔具有性逆轉性，初期鱔苗全為雌性，產卵后變為雄性。當長到24厘米時開始性逆轉，為雌雄同體。
三、繁殖季節的特征
雌鱔腹部半透明粉紅色，腹內卵粒可見，生殖孔紅腫，稍透明；雄鱔腹部分布有網狀血絲，無突出感覺，生殖孔紅腫，稍突出。
四、個體差別
體長24厘米以下均為雌性；體長24-30厘米、30-36厘米、36-42厘米的黃鱔，雄性分別占5.2％、41.3％、90.7％；體長50厘米以上的全為雄性。
五、年齡
人工養殖黃鱔由于營養供應充足且品種有異，會出現超乎尋常的體長，可以根據年齡判定雌雄，一般兩齡以內的都是雌鱔，三齡以上的都是雄鱔。
