1、植物莖不同：扶桑花是木本植物，屬常綠灌木或小喬木；芙蓉花是草本植物，屬落葉灌木或小喬木。2、花不同：扶桑花大且美麗，主要有緋紅、淡紅、桃紅及黃白等色；芙蓉花一般指四面花，花多為白色或淡紅色。3、花期不同：扶桑花花期為全年；芙蓉花的花期在10-11月。
一、植物莖不同
扶桑花是木槿花木本，為常綠灌木或小喬木；芙蓉花是草本，為落葉灌木或小喬木。
二、花不同
1、扶桑花的花藥成熟后，可以看到球形的花粉粒，紅色的部分是花絲，所有的花絲合成一束，叫做單體雄蕊。扶桑花的柱頭五裂，上面有絨毛狀的凸起，花朵又大又漂亮，花瓣五片，先端分裂，里面包含了雄蕊，只露出五分叉的花柱，幾乎是最盛的，花又大又漂亮，有緋紅、桃紅、黃白等顏色。
2、芙蓉花（木槿屬植物）一般指四面花，花初開時白色或淡紅色，后變深紅色，直徑約8cm，花瓣近圓形，直徑4-5cm，外面被毛，基部具髯毛；雄蕊柱長2.5-3cm，無毛；花柱5，疏被毛。蒴果扁球形，直徑約2.5cm，被淡黃色剛毛和綿毛，果爿5。
三、花期不同
扶桑花花期全年；芙蓉花在10-11月開花，早晨開花時呈乳白色或粉紅色，傍晚變成深紅色。
四、生長環境
扶桑花喜歡溫暖潮濕的氣候，不耐寒霜，耐陰，適合在陽光充足、通風充足的地方生長，對土壤要求不嚴格，但在肥沃疏松的微酸性土壤中生長最好，冬季溫度不低于5攝氏度；芙蓉花喜歡溫暖潮濕的氣候，喜歡陽光，適應性強。
五、價值
扶桑花色彩鮮艷，四季常開，主要用于園林觀賞，藥用具有清肺、涼血、化濕、解毒的功效；芙蓉花極美，是深秋觀花的主要樹種，用途廣泛，樹皮纖維可搓繩織布，根、花、葉均可入藥。
