山茱萸是山茱萸科植物山茱萸干燥成熟果肉，吳茱萸是蕓香科植物吳朱山、石虎或疏毛吳朱山干燥近成熟的果實。山茱萸與吳茱萸是性味不同、歸經不同、效果不同、用途不同的中藥材，兩者不可混淆，更不可相互代替。在外觀上也有一定的區別，山茱萸呈不規則的片狀或囊狀，吳茱萸呈球形或稍五角形扁球形。
一、山茱萸
山茱萸為山茱萸科植物山茱萸干燥成熟果肉，分布在山西、江蘇、浙江、安徽、江西、山東、河南、湖南、四川、陜西、甘肅等地，具有補肝腎、收斂固脫的效果，常用于眩暈耳鳴、腰膝酸痛、陽痿遺精、遺尿頻繁、泄漏帶下、汗水脫落、內熱消渴等癥狀。
二、吳茱萸
吳茱萸是蕓香科植物吳朱山、石虎或疏毛吳朱山干燥近成熟的果實，具有降寒止痛、降反止嘔、助陽止瀉的效果，常用于暈厥頭痛、寒疝腹痛、寒濕腳氣、腹痛、腹脹痛、嘔吐吞酸、五更腹瀉等癥狀。
三、山茱萸與吳茱萸的區別
1、性味不同：山楂酸、澀、性微溫。吳氡味辛苦，性熱，有小毒。
2、歸經不同：山楂歸肝、腎經。吳氡歸肝、脾、胃、腎經。
3、效果不同：山楂有補肝腎、澀精脫落的效果。吳氡具有散寒止痛、止嘔、助陽止瀉等效果。
4、主治不同：山朱山經常用于眩暈耳鳴、腰膝疼痛、陽痿遺精、遺尿頻率、泄漏帶下、汗水脫落、內熱解渴等癥狀。吳氡常用于土耳其陰部頭痛、寒疝腹痛、寒濕腳氣、經行腹痛、腹脹痛、嘔吐吞酸、五更腹瀉等癥狀。
5、外觀不同：
（1）山茱萸呈不規則的片狀或囊狀，表面紫紅色至紫黑色，皺紋，有光澤，頂部有圓形宿管痕跡，基部有果梗痕跡，質量柔軟。
（2）吳茱萸呈球形或稍五角形扁球形，直徑2~5毫米，表面暗黃綠色至褐色，粗糙，有許多點狀突起或凹陷的油點，頂部有五角形星形裂縫，基部殘留有黃色毛的果梗，質硬脆，橫切面可見子室5室，每室有淡黃色種子1粒，味濃郁。
