病害發生前，一般選擇保護性殺菌劑，病害發生初期，一般選擇內吸性殺菌劑或與保護性殺菌劑混用。除此之外，不能長期連續使用同一種殺菌劑，避免產生抗藥性。
如果是秧苗帶菌，需在移栽前進行消毒處理。如果是土傳病害，需對土壤、苗床進行消毒處理。如果是空氣傳播的病害，可葉面噴霧、噴粉防治。如果是蚜蟲、飛虱等害蟲傳播所導致的病害，應以治蟲為主。
一、怎么選擇合適的殺菌劑
1、要徹底貫徹以預防為主的方針，治防結合。病害發生前選用保護性殺菌劑，病害發生初期選用內吸性殺菌劑或與保護性殺菌劑混合使用。
2、根據傳病規律，采取相應對策如蚜蟲、飛虱等傳播病毒造成的病害，則應在帶毒害蟲為害作物前治蟲。秧苗帶菌則應先處理秧苗后下田。土傳病害大多采用藥劑處理土壤、苗床。對氣傳病害，大都用常規葉面噴霧、噴粉。銹病、白粉病為害麥類，也可以用內吸劑處理種子。
3、針對作物需防治的病害，對癥選藥選擇有效的，不是一藥治百病，也不可盲目地追求、廣譜。
4、重視一些常用保護性劑的使用，不要刻意追求內吸、廣譜殺菌劑，例如波爾多液及銅制劑、石硫合劑、百菌清、代森錳鋅等是近年廣泛應用的品種。
5、合理輪用不能連續使用同一種殺菌劑，也不可一個生長期連續數次用同一類殺菌劑，對內吸性殺菌劑應限制使用次數，輪換使用其他不同作用機制的殺菌劑。
6、合理混用長期使用內吸性殺菌劑，病菌容易產生抗藥性，使用時可與保護性殺菌劑如代森錳鋅等搭配使用。
7、避免不正確的混用，如代森錳鋅不可與銅制劑、汞制劑、強堿性農藥混合使用，石硫合劑不能與波爾多液等銅制劑、堿性條件下易分解的農藥混合使用。
二、內吸性殺菌劑的常用品種
內吸性殺菌劑的常用品種（類型）有多菌靈、三唑酮、戊唑醇、甲霜靈、乙磷鋁、力克菌、綠亨2號、多霉清、霜疫清、噻菌銅、敵克松、甲霜銅、殺毒礬、拌種雙、粉銹寧以及甲基托布津等。
