育苗是設施白蘭瓜栽培的關鍵環節，育苗的好壞直接關系到以后的生長。
配制營養土：用大田土、充分腐熟的有機肥、少量化肥及殺菌劑配成營養土。大田土以上茬沒有種過蔬菜、棉花，特別是沒有用過除草劑的為好。大田土占60%～70%，然后過篩。有機肥占30%～40%，必須充分腐熟后才能使用，忌用生糞。在配制前也要過篩。為提高營養土的肥力，應按每立方米營養土2 公斤的量摻入三元復合肥，每立方米營養土中還應摻入多菌靈或其他殺蟲、殺菌劑進行土壤消毒、殺蟲。
裝缽：向營養缽內裝營養土，注意不要裝滿，要距營養缽沿2～3厘米，以便將來澆水時能存儲一定水分。裝缽后，將營養缽整齊地擺放在苗床內。
白蘭瓜種子處理：將種子倒入55℃的水中，并不停攪拌，保持這一溫度10分鐘，33℃時方可浸種，浸種6小時左右開始催芽，用手巾裹好。把出芽的揀出來，未出芽的繼續生芽，大部分出齊后第二天可播種。催芽時注意天氣變化，要求3～5天好天氣，連續陰天不要下種。
白蘭瓜播種：為保證育苗期間充足的水分，減少幼苗生長期間的澆水量，在播種前要澆足水。注意地溫，必須達到15℃以上時才能播種。
為防治猝倒病、立枯病等苗期病害，白蘭瓜播種前于畦面噴灑惡霉靈可濕性粉劑3000倍液，每10平方米噴灑1公斤左右，噴藥后隨即播種。
每個營養缽中放一粒種子，種子芽朝下或平放，然后種子上均勻鋪2厘米厚潮濕的土。苗床上搭建塑料拱棚，苗床上覆蓋地膜，使播后苗畦土壤溫度達到25℃～30℃。出苗期間白天溫度不超過35℃不通風，土壤溫度保持在25℃～32℃，夜間保持在17℃～22℃，凌晨最低不低于12℃。溫度達不到時可用地熱線增加溫度。較高的溫度能促進早出苗，出齊苗。
在第一片真葉展開前，要通風使溫度不超過28℃，防止形成高腳苗。定植前一周要使苗多見光，以培育壯苗并促進花芽分化。從定植前5～7天開始，要撤去苗床小拱棚，并增大通風量，延長通風時間，進行低溫煉苗。并注意此時不澆水，以便栽后緩苗快。
定植時白蘭瓜幼苗應有4～5片真葉，葉片平展，淡綠，側根較多，株高15厘米左右，全株無病蟲害。
