馬配種方法分為自然交配和人工授精兩種。

自然交配分為自由交配和控制交配。自由交配就是將公母馬按照1︰25~1︰35的比例進行混群，讓它們進行自由交配。

自由交配的優(yōu)點是方便省事，管理簡單。缺點是公馬之間相互角斗爭配母馬，交配無限制，不能安心吃草，既消耗公馬精力，也影響母馬采食，容易傳播一些傳染病和寄生蟲疾病，特別是生殖系統(tǒng)疾病。不能準(zhǔn)確掌握產(chǎn)羔日期，羔馬日齡差距較大，也無法鑒定羔馬血統(tǒng)，還不能最大限度利用種公馬。

控制交配就是在配種期間用試情公馬放在馬群中試情，把發(fā)情母馬挑選出來，再與指定公馬交配。

控制交配是介于自由交配和人工授精之間的一種方法，優(yōu)點是有利于選種選配工作進行，能掌握馬群血統(tǒng)關(guān)系，控制配種日期和產(chǎn)羔時間，提高公馬配種頭數(shù)，也能充分選擇利用優(yōu)秀種公馬，對提高群體生產(chǎn)性能有一定作用。控制交配的缺點是費工麻煩，管理繁瑣，不能完全發(fā)揮種公馬利用率。

人工授精是目前先進的配種方法。這種方法不需要公母馬直接交配，借助采精和輸精器械的幫助將公馬精液采出，經(jīng)過適當(dāng)處理后，再輸?shù)侥格R體內(nèi)使母馬妊娠。

人工授精的優(yōu)點是減少種公馬的飼養(yǎng)頭數(shù)，節(jié)省草料成本，一只種公馬可給300只~500只母馬輸精，可以充分發(fā)揮優(yōu)秀種公馬的配種能力，提高公馬利用率，防止疾病發(fā)生，能掌握馬群血統(tǒng)關(guān)系，還能自主控制配種日期和產(chǎn)羔時間。

人工授精的缺點是需要設(shè)置必要的儀器和設(shè)備，操作人員要掌握人工授精方法。如果母馬排卵時間掌握得不好，不能適時輸精，會影響受胎率。

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