蛤蚧是變溫動物，體溫隨環境溫度的變化而變化。環境溫度適宜，蛤蚧食欲旺盛、食量增加，生長速度加快；溫度降低時蛤蚧體溫降低，活動量減小，食欲減退，食量小或不食，生長速度降低或不長。一年四季的溫度變化能給蛤蚧帶來一系列的生理變化。
當溫度達到１２℃以上時，蛤蚧能出來活動；當溫度降低到１２℃以下時，蛤蚧新陳代謝水平大大降低，停止活動和取食，進入冬眠狀態；當溫度升到１３～１４℃時，蛤蚧從冬眠狀態醒來開始活動，但還不取食；當環境溫度升到１８℃時，活動頻繁并開始取食。在人工飼養條件下，有人將室內溫度保持在２０℃，企圖打破其冬眠狀態，蛤蚧能出來活動，但取食量很小，活動期不長，這樣倒不如讓其冬眠，因為活動要消耗體內物質，對第二年的繁殖不利。蛤蚧在高溫環境下，體溫升高，因失水容易造成死亡。
當環境溫度２６～３０℃時，蛤蚧反應正常，呼吸頻率３０～５５次／分，當環境溫度達到４０℃時，１５分后便表現煩躁不安，張口吐舌；當環境溫度升高到４５℃時，呼吸頻率加快到１２０次／分，開始亂竄，指（趾）翻卷，失去爬行能力和吸附力，肢體僵硬，尾不能動，向上高高翹起；４５℃的溫度持續２５分，能使蛤蚧停止呼吸。蛤蚧喜溫暖怕寒冷，自然條件下分布在北亞熱帶無霜雪的地方，冬季氣溫在０℃以下的地方極少有分布。在人工飼養條件下，越冬室內溫度在１０℃左右，這樣可安全越冬。經過觀察發現肥而健壯的個體能忍受５℃左右的溫度，瘦弱的個體能忍受８℃左右的溫度，幼小的蛤蚧在１３℃的溫度下就被凍死。
