熱帶魚所賴以生存的水環境，除了溫度、陽光、水質標準外，還需要一種和諧的生態環境，優質的水環境，是一種可以自我調節的生態系統。簡單點說就是熱帶魚所制造的代謝物和水體內有益菌落處理廢物的能力達到基本平衡。這樣的環境除了機械過濾系統還要依靠生態系統來達到水的自清和自凈。

　　有些人認為養幾只清道夫和鯰科的魚就可以清潔水體，這是錯誤的概念。經常有魚商向購買者灌輸這樣一種概念：買幾只清道夫吧，這魚吃別的魚的排泄物。這是胡弄新手的伎倆，只會騙你多買幾條魚。這類魚是具有吸食青苔和剩餌的習性，對清潔魚缸起到一定的作用。但它們不會去吃別的魚的排泄物，不要忘記了它們同樣也要新陳代謝，同樣也產生廢物。也對水環境起到影響作用。

　　要想徹底的解決水環境的問題，就不得不說硝化細菌了，硝化細菌是將水環境中的氨氮等廢物轉化為對魚兒沒有傷害的硝酸鹽，降低有害物功能的生物菌種。它不是單一的一種細菌，而是復合細菌，一種是把氨氮轉化為亞硝酸鹽的細菌，另一種是把亞硝酸鹽轉化為硝酸鹽的細菌，因此硝化細菌是具有兩種功能的組合細菌。這些細菌都屬于附著性好氧細菌，因此必須提供附著物和溶氧供其生存。讓水流不斷的通過富含硝化細菌的濾材，就能能達到水體的自我修復功能了。

　　硝化細菌真是神奇啊，那培植它挺難的吧?其實非常簡單首先要為它們提供附著物，附著物必須是表面積大的多孔材料，如：生化棉、生化球、陶瓷環等材料的附著性都很好。將這些材料組合排列，選擇的材料越多，濾水面積越大，水的自我修復功能就好。再次就是要使水流保持一定的速度通過濾材，這樣水中的溶氧量才能為這些附著的硝化菌落提供生存的氧含量。

　　取得硝化菌的方式通常有有兩種，一種是依靠水體的自身培養，這個過程是緩慢的，水生生物生活一段時間后，水體內會自動產生少量的硝化菌，時間在15-20天左右。而現在大多數人都采用人工的方法，即從市場上購買現成的硝化細菌，這種硝化菌具有密度大，含量高，菌落快速形成的特點，初期建立生態系統只需5-7天時間。

　　注意以下問題：

　　1、普通的過濾棉對培養硝化細菌沒有多少作用，不宜采用這種材料作為附著物培養。

　　2、硝化菌屬于好氧菌，必須提供充足的溶解氧，因此必須保證水流通過附著物。

　　3、不要過分的清洗附著物，造成硝化菌的大量流失。

　　4、防止水體的大量酸化。