黑魚苗最適的開口餌料便是個體小的浮游動物輪蟲。隨著魚苗長大便能攝食較大的枝角類浮游動物和更大的橈足類浮游動物了。在培育黑魚苗種時，為了提高苗種成活率，必須針對黑魚苗不同生長發育階段及時提供足夠的動物性餌料，否則苗種成活率便會明顯降低，甚至完全失敗。

池塘清塘灌水后，浮游動物種群發展是比較有規律的，一般按如下次序先后出現優勢，個體從小到大也按該次序出現：即纖毛蟲和濾食性輪蟲—肉食性輪蟲—小型枝角類—大型枝角類—橈足類。

從浮游生物世代時間看，大約水溫25℃時，向池塘施肥5～7天后，就會形成浮游生物高峰。這時，魚苗下塘可獲得豐富的適口餌料，對提高成活率和促進生長有利。因此，一般清塘后，估計放苗前5～7天，注水并立即施放有機肥料比較適當。施基肥的種類和數量可因地制宜，一般每畝施糞肥300～400千克或綠肥400～500千克，或混合有機肥600千克。若是草的質量差，數量應適當增加。為了促進肥水可兼施無機肥，如氨水5～10千克或硫酸銨、碳酸氫銨4千克，加過磷酸鈣3～4千克。糞肥可采用全池潑灑或塘角堆施，堆施后要間隔數天用耙翻動，泄放毒氣，加速腐爛分解。綠肥也用塘角堆施，或將豆科等扎成束固定沉放在池周。無機肥則采用加水溶解，全池潑灑。一般池塘施肥后各類浮游動物高峰期的出現順序要與黑魚從小到大的生長順序相吻合。施肥過早，黑魚仔苗下塘時輪蟲高峰期已過，大型枝角類繁殖，難以成為初期黑魚仔苗餌料，而且消耗水中氧并攝食藻類、細菌、有機碎屑等，抑制輪蟲繁殖；施肥過晚，輪蟲繁殖高峰尚未出現。因此，要做到因地制宜，適時施肥。

施肥時間應視天氣、水溫、肥料種類而定。黑魚繁殖季節天氣正常，可在黑魚仔苗下塘前5～7天施肥，施綠肥需要有腐爛分解的過程，時間應提前1～3天，腐熟糞肥或混合堆肥則可縮短1～2天。

輪蟲是黑魚仔苗開口餌料，輪蟲繁殖數量和達到高峰的時間與輪蟲休眠卵數量及水溫密切相關。要是塘底淤泥較厚，保水力強，并大量追施有機肥料，淤泥中輪蟲休眠卵就多。另外，輪蟲休眠卵廣泛分布于不同深度的淤泥層中，由表及底逐漸減少。一般表層5厘米左右淤泥中最多，而完全在泥表的卻很少，只有完全暴露在泥表面或漂浮于水層中的休眠卵才能萌發。所以在清塘之后用鐵耙攪動表層淤泥，將休眠卵翻動到泥表或水層中，可以促進其萌發。在一定溫度范圍內，輪蟲休眠卵萌發時間隨溫度升高而縮短。水溫25℃時，池塘清整后約5天輪蟲數量可達高峰期。但有時生石灰清塘，使部分泥面被石灰覆蓋而會影響到休眠卵的全面萌發而推遲峰期的出現。所以清塘后鐵耙攪動可以使石灰漿和淤泥充分混合以提高生石灰的清塘效果，同時也可以幫助休眠卵翻到泥表有利于輪蟲萌發和提前達到高峰期。

輪蟲繁殖的高峰期通常能持續3～5天，之后會因食物減少，枝角類等侵襲而迅速下降，這時可適當追施肥料，針對黑魚魚苗生長情況加喂人工飼料。輪蟲數量可用玻璃杯取池水來粗略估計，杯子對著陽光觀察，要是每毫升含10個小白點（即為輪蟲），表明每升水約含輪蟲1萬個。

施肥選擇晴天下午2點左右進行，此時浮游植物光合作用最強，水中溶解氧處在飽和與過飽和狀態，能使肥效發揮快、效果好。為保持池水中的浮游生物量，應采用勤施少施的方法，不等到水色變淺就及時追肥，使水色始終保持黃褐色或黃綠色，使水質肥而爽，池內生物量始終保持高峰狀態。根據魚苗不同生長階段的需要量來確定施肥投餌，這是降低成本、增加產量、減少污染的有效方法。