小龍蝦的生理特性和對生態環境要求與魚類不同，所以在疾病防治方面也有許多不同點，目前的防治原則還是以防為主，防重于治。
藥物預防藥物預防主要是做好消毒處理，采用生石灰等消毒劑，平時管理中應重點加強小龍蝦活動區域的消毒處理，適當投喂藥餌。藥物使用應遵循以下原則；
（1）缺氧時不用藥。
（2）一在晴天上午9-10時用藥。
（3）連續用藥時間不宜太長，不能超過3天。
（4）稻田養蝦只在蝦溝內用。
非藥物預防小龍蝦對漁藥的抗耐性較差，所以生態防治方法尤為重要，尤其是魚蝦混養的池塘，平時運用有益的預防方法，不僅能減少開支，而且能提高產量。
（1）改善棲息環境，加強水質管理。主要是清除池底過厚淤泥，勤換水，種植水生植物，使水體中的物質始終處于良性循環狀態，不投喂腐敗變質飼料，解決池水老化等問題。
（2）水溫25℃以上時，可以有選擇地使用一些生物改良劑，使用方法可參照說明書，現在的生物改良劑很多，一般不會對小龍蝦產生危害。另外也可以適當投放一些河蚌螺螄調節水質，或者是鰱鳙魚苗。
（3）進排水口和池埂上要設網片，嚴防敵害生物進入，發現蝦池中有烏鱧、鱖魚、蛙、蟾蜍、水蛇、泥鰍、黃鱔、鼠等敵害生物時，要及時采取措施清除。
此外，在4月下旬左右，如發現養殖的小龍蝦出現不攝食，反應遲鈍，抗應激能力較弱，螯肢及附肢無力，血淋巴不易凝固，肝胰腺顏色淡黃，腹節肌肉蒼白，頭胸甲部位出現白斑等癥狀，則極有可能已感染白斑綜合征病毒，需要及時加以控制，進行必要的隔離。
