小龍蝦常見的疾病可分為病毒性疾病、細菌性疾病、真菌性疾病與固著類纖毛蟲病等。
1、白斑綜合癥
〖病原〗白斑綜合癥病毒。WSSV為有囊膜的桿狀病毒。
〖主要癥狀〗該病發病急，死亡率高。蝦患病初期停止攝食，隨后有瀕死蝦在池塘邊的水面上游動，其表皮具圓形的白色顆粒或白斑。
對蝦頭胸甲有大量白斑
〖防治方法〗第一天全池潑灑“精品一元笑”，第二天全池潑灑“聚維酮碘溶液”或“頂典”，第三天全池潑灑“鱖魚康”；外用藥物時同時口服“服爾康+肝膽利康散+酶合電解多維”3～5天。
〖注意事項〗①外界環境應激如高pH或細菌病也可能導致蝦甲殼上出現白斑；②確診患病毒病時不得使用強刺激性藥物；③飼養活動應以避免小龍蝦產生應激為原則。
2、固著類纖毛蟲病
〖病原〗由聚縮蟲、、鐘形蟲等固著類纖毛蟲寄生引起。
〖主要癥狀〗患病蝦行動遲緩，食欲下降，乃至停食。固著類纖毛蟲在蝦體大量寄生后，肉眼即可看見一層灰白色、淺綠色的絨毛狀物，全身粘滿污物，妨礙蝦的活動、攝食、脫殼，影響蝦的生長。患病嚴重時，會影響克氏原螯蝦的呼吸而造成大量死亡。固著類纖毛蟲常寄生于克氏原螯蝦的體表、附肢、鰓等處。
蝦爬于塘邊，附肢可見明顯絨毛狀附著物
固著類纖毛蟲常與絲狀藻類或其它原生動物共存，在蟲體之間還粘附一些單細胞藻類、有機碎屑和污泥等，從而使寄生部位發生色澤變化，如變為黑色俗稱為“黑鰓”，這與鰓部附著的污物顏色有關。
〖防治方法〗①全潑潑灑“硫酸鋅粉”；②第一天全池潑灑“硫酸鋅粉”，第二天全池潑灑“底立爽”或“中博高”；③第一天全池潑灑“硫酸鋅粉”，第二天全池潑灑“活力66+磷酸氫鈣或磷酸二氫鈣”。
〖注意事項〗①克氏原螯蝦脫殼期間禁止使用藥物全池潑灑；②如克氏原螯蝦體表有大量的絲狀藻類附著時，可在使用“硫酸鋅粉”全池潑灑前，先用一次“苯扎溴銨溶液”全池潑灑；③為預防細菌性疾病感染，建議在潑灑“硫酸鋅粉”后全池潑灑1次“底立爽”或“中博高”。
