1、科屬區別：胡椒為胡椒屬木質攀援藤本植物；花椒為花椒亞屬落葉灌木或小喬木。2、形態區別：胡椒莖、枝無毛，常生小根；花椒莖干上的刺常早落，枝有短刺。3、產地區別：胡椒原產于東南亞；花椒產地北起東北南部，南至五嶺北坡。4、功效區別：胡椒有溫中散寒、下氣、祛痰的功效；花椒有溫中止痛、殺蟲止癢的功效。
一、胡椒和花椒的科屬區別
1、胡椒
胡椒是植物界、被子植物門、雙子葉植物綱、原始花被亞綱、胡椒目、胡椒科、胡椒屬木質攀援藤本植物。
2、花椒
花椒是植物界、被子植物門、雙子葉植物綱、原始花被亞綱、蕓香目、蕓香亞目、蕓香科、蕓香亞科、花椒屬、花椒亞屬落葉灌木或小喬木。
二、胡椒和花椒的形態區別
1、胡椒
胡椒莖、枝無毛，節顯著膨大，常生小根。葉子厚，近革質，闊卵形至卵狀長圓形，稀有近圓形，花雜性，通常雌雄同株，花序與葉子對生，短于葉或與葉等長，總花梗與葉柄相近等長，漿果球形，成熟時紅色，未成熟時干燥后變黑色，花期6~10月。
2、花椒
花椒植株高3~7米的落葉小喬木，莖上的刺常早落，枝上有短刺，小枝上的刺基部寬而扁且勁直的長三角形，當年生枝被短柔毛，葉子是對生，花序頂生或生于側枝之頂，果紫紅色，花期是4~5月，果期是8~9月或10月。
三、胡椒和花椒的產地區別
1、胡椒
胡椒原產于東南亞，中國臺灣、福建、廣東、廣西、云南等省都有栽培，印度尼西亞、馬來西亞、斯里蘭卡、巴西等是胡椒的主要出口國。
2、花椒
花椒適合溫暖濕潤和土層深厚肥沃的壤土、沙壤土，萌蘗性強，耐寒，耐旱，喜陽光，抗病能力強，產地北起東北南部，南至五嶺北坡，東南至江蘇、浙江沿海地區，西南到西藏東南，臺灣、海南和廣東不產。
四、胡椒和花椒的功效區別
1、胡椒
胡椒味辛，性熱，歸胃、大腸經，具有溫中散寒、下氣、祛痰的功效，主要治療腹痛泄瀉、食欲不振、癲癇痰多等癥狀。
2、花椒
花椒味辛，性溫，歸脾、胃、腎經，具有溫中止痛、殺蟲止癢的功效，用于脘腹冷痛、嘔吐泄瀉、蟲積腹痛等癥，外用治濕疹、陰癢等。
