(一)采收。木瓜由開花至果實成熟約為120～210天。如過早采收，果實難以后熟，過熟采收則不耐貯運。適時采收的標準是：
1.果皮顏色。木瓜果皮色澤的變化是由粉綠→濃綠→綠→淺綠→果端黃綠色→果端黃色。先在果實中部的兩個心皮間出現黃色條紋斑后，果皮部分變黃時可以采收。如遠銷外地，可在黃色條斑出現前采收。
2.果汁。隨著果實趨于成熟，乳汁顏色由白變淡，至輕微混濁的半透明狀，汁液數量少，流速慢，較易凝集。果實在樹上成熟時，乳汁基本消失，此時采收可供就地食用。
采收時果實要輕摘輕放，避免碰傷果皮。采后要削平殘留在莖上的果柄，以便不影響其他果實的生長。
(二)采后處理。木瓜為易腐爛水果，采后易有果皮表面腐爛、蒂腐病、炭疽病和霉病等，必須經過采后處理，方能抑制病變和延長貯藏保鮮期。采后處理步驟如下：
1.洗果。木瓜采后立刻用清水清洗果皮上的污染物。亦可用1%醋酸清洗。增加果皮光潔度，提高商品價值。
2.熱水處理。46～48℃浸泡20分鐘或用54℃熱水噴霧處理3分鐘，不僅可防治貯藏期和裝運期蒂腐病，炭疽病，又可延長后熟期。
3.殺菌劑處理。熱水處理后再用500ppm涕必靈或500ppm克菌丹浸漬20分鐘，更能防治木瓜的貯藏期病害。
(三)催熟。就地銷售或自己食用的木瓜有時需要進行催熟。催熟的溫度一般以25～30℃為宜，冬季必須在室內進行加溫處理。全青果實用乙烯利處理后，雖能轉色，但風味淡，不好食用，最好采有一定成熟度的果實催熟，乙烯利可用原藥涂蒂或用2000ppm洗果。
(四)貯藏保鮮。木瓜經熱水和藥物處理后，晾干，于10～12℃低溫下可貯藏4周，幾乎無病害發生，可售率達95%～100%。
(五)包裝。用于遠銷或出口的木瓜，應分級包裝，并以紙箱為宜。每個果都應套袋，果蒂朝下，間隙以紙纖維或木纖維為填充物，小心搬運，防止碰傷、擦傷和壓傷。
