蒼蠅資源的開發利用主要有如下幾方面：
( 1 )飼料開發利用
蒼蠅是多化性蠅類，食性和孳生物廣泛，其幼蟲的蛋白質含量高，用來喂養家禽和珍奇動物有廣闊的應用前景。
( 2 )作為實驗材料
國內外有很多報道，利用蒼蠅、果蠅和麻蠅等生活史周期短、繁殖率高、成本低和容易表達等特點，來進行農藥毒理學、遺傳學、抗衰老機理的研究。也有的用來做實驗動物，進行神經、視覺、嗅覺等生物學基礎理論的研究。
( 3 )在法醫上的應用
利用蠅蛆在不同條件下的生長狀況、齡期大小等特點，判斷尸體的死亡時間和死亡期限，作為法醫鑒定的參考指標。
( 4 )國防建設中的應用
國防上利用蠅類個體小，飛行范圍廣等特點，有的進行標記釋放．觀察飛翔距離，獲取情報；有的攜帶竊聽器（特種物質），釋放后進行竊聽、監視和收集有關數據；還有的利用蠅類特殊視覺器官和善飛行等特點，進行仿生和改進飛機、飛行武器的研究。
( 5 )提取特殊的抗菌和抗毒物質
目前有許多研究報告表明可從蒼蠅等不同蠅種的中腸提取和分離抗細菌的蛋白質，這種蛋白質可以抵抗某種細菌的感染，現已應用于抗細菌治療和抗毒等方面的研究。
( 6 )對環境的凈化作用
蠅蛆在自然界生態循環中起著極為重要的凈化作用。早在1893年英國生物學家SIBTHORPEE．H在他寫的“霍亂與蒼蠅”一文中，曾提出蒼蠅是擔任極為重要的“清道夫”的角色。它可以減少霍亂的傳播。從達爾文進化觀點來看，尚無人類存在以前，在物種之間，早有生存競爭及自然選擇的現象，在生存竟爭中被殘殺的動物遺體腐爛時發出臭味，這種惡臭主要是尸胺（Cadaverine ）即五甲烯二胺。蒼蠅的觸角上有很多的化學感受器，在遙遠的地方就能感受到這種氣味，然后飛向尸體，在那里產卵生蛆，只要尸體還在散發惡臭；嗅覺敏感的蒼蠅就能繼續不斷的飛來產卵。因此，在尸體上密密麻麻的布滿了大小不等的蠅蛆，直到把尸休上的血肉全部消費掉，只剩一個骨架子，消除了臭味，起到了凈化環境的作用，因此，將蒼蠅比喻作一個“清道夫”是非常有道理的。
( 7 )安全性毒性試驗
據報道可利用敏感蒼蠅檢測蔬菜上農藥的殘留。具體方法是在蔬菜產品采收前先采取一定數量的檢測樣品，一般為采取總量的12000，搗碎，拌勻，放入檢測試驗瓶中，每瓶用量5克，平鋪于瓶底，再放入敏感蒼蠅。每瓶50只，讓蒼蠅與樣品經過一定時間的接觸，然后檢查結果，如蒼蠅大量死亡，說明菜中含有大量殘毒；如無一死亡，說明蔬菜無毒；若部分死亡，說明有一定量的殘毒，對于超標的蔬菜，不準上市，確保消費者利益。
( 8 )仿生學上的應用
模仿蒼蠅嗅覺器官而設計的極為靈敏和小型的氣體分析儀，已在宇宙衛星座艙中工作，另一種模仿蒼蠅復眼而制造的新式照相機“蠅眼”，一次能拍攝1 329張照片，分辨率達每厘米4 000條線，可用于大規模集成電路的制板工作；蒼蠅翅膀后面的兩根平衡棒的作用原理，也已被模仿制成了無摩擦陀螺儀。這種儀器無轉動部分，體積很小，可以應用到高速飛行的飛機和火箭上。
