羅非魚的健康養殖是關系到能否取得預期經濟成效的大事，甚至是關系到食用者健康的大事。做好這項工作，關鍵是增強資源利用和環境保護兼顧意識。
生產的水產品，注意具備規范化、標準化、產業化生產的基本條件。也要從日常管理中消除健康隱患，例如做好容易忽視的消毒工作。首先，做好養殖場所的消毒工作。包括池水使用生石灰消毒或使用漂白粉全池潑灑，用生石灰或漂白粉干法清塘，經烈日曝曬和冰凍，可殺死許多病菌和寄生蟲卵，為魚類創造良好的棲息場所，是增產非常重要的措施之一。其次，是食場消毒和工具消毒。在魚病流行季節還要定期進行食場消毒和經常性注意投飼衛生，潑灑漂白粉水溶液是一種比較行之有效的方法。生產工具，尤其是接觸病魚、死魚的工具一定要用5％漂白粉水溶液浸泡消毒，除了對水體、食場、工具用生石灰、漂白粉等藥物徹底消毒外，也要堅持苗種消毒。魚種入池前應用藥物浸洗法消毒，在消毒前應先抽樣檢查魚體上病原體情況，有針對性地采用相應的藥物消毒。通常都是用藥浴法，即將魚放入較高濃度的藥液中，經過一定時間的洗浴，殺死魚體上的病原體。一般先要檢查魚體，確定將要殺滅的病原體種類，再選用適宜的藥物。藥浴時間的長短，依魚體大小、種類、水溫、藥液種類及濃度和魚的耐受力靈活掌握。可按照一般給魚消毒的劑量，用食鹽2％～5％浸浴5分鐘，或用漂白粉水溶液浸洗10～30分鐘。在魚病流行季節還要定期進行食場消毒和經常性注意投飼衛生，潑灑漂白粉水溶液是一種比較行之有效的方法。平時管理時，用具和網具也應定期消毒。在羅非魚的養殖中，消毒和預防魚病的藥物最常用的有：1．食鹽：配制濃度為2％～4％，浸洗5～10分鐘，主要預防三代蟲病和指環蟲病等。2．硫酸銅：使用濃度為每立方米水體8～10克，浸洗10～20分鐘，主要預防車輪蟲等在魚體表寄生的原生動物病。3．漂白粉：使用濃度為每立方米水體10～20克，浸洗時間10～15分鐘。具體時間可根據水溫及魚的活動情況靈活掌握。可預防體表及鰓部的細菌性魚病。4．敵百蟲：使用濃度為每立方米水體10克，浸洗時間15分鐘，可預防部分原生動物、指環蟲和三代蟲等病。5．漂白粉和硫酸銅（10:8）合劑：浸洗10～20分鐘，用藥期間注意觀察魚的活動情況確定用藥時間。主要預防細菌性皮膚病，鰓病及大部分原生動物引起的皮膚病和鰓病。從殺菌目的來說，以生石灰和漂白粉兩種最為經濟，殺蟲用的藥物以硫酸銅和硫酸亞鐵合劑用的較多。
投喂藥餌因為要將藥拌入餌料中進行投喂，所以人工顆粒飼料一般將藥物、魚餌以及黏合劑按比例混合，制成含藥顆粒餌料投喂。中草藥餌，可以將藥物混合于黏合劑中調成糊，然后將其涂灑在草料上，略干后投喂，常用的口服藥有魚服康A型、B型及腸炎靈、大蒜素等。
