正常采收：菌蓋剛展開，菇體達8分熟時就要采收。
內銷產品：菇體達到7-8成熟，菌蓋邊緣近平展，菌褶尚未散發孢子之前就要采收。
外銷產品：菇體達到6成熟，菌蓋內卷尚未展平時就要采收。
注意事項：不可等到子實體倒下、菌褶變黃時才采收，否則會降低長根菇的品質。
一、采收長根菇的標準
1、正常采收
（1）菌蓋剛展開，菇體達到8分熟時便要采收。
（2）采收時要握住菌柄的下部，再輕輕向上拔起，隨即清理基部的雜物即可上市鮮銷，也可以將菌體烘干，制成干品后再出售。
2、內銷產品
當菇體達到7-8成熟，即菌蓋邊緣近平展，菌柄未充分伸長，菌褶尚未散發孢子之前便要采收。
3、外銷產品
當菇體達到6成熟左右，即菌蓋內卷、尚未展平時便要采收，以便包裝和托運。
4、注意事項
無論是內銷還是外銷，皆不能等到孢子大量飛散、子實體倒下、菌褶變黃時再采收，否則會影響到長根菇的產量和品質。
二、長根菇與雞樅菌有什么區別
1、顏色不同
（1）長根菇：通體呈淺褐色。
（2）雞樅菌：有黑皮、白皮、黃皮、花皮等多種類型。
2、形狀不同
（1）長根菇：菌柄近似柱狀，菌蓋為半球形至平展狀，中部微凸起，呈臍狀。
（2）雞樅菌：菌柄粗壯，菌蓋光滑，頂部顯著凸起，呈斗笠形；傘尖似鐵鋼，用手指按壓傘尖時其硬度似有鐵器在扎手。
3、手感不同
（1）長根菇：肉質纖維，質地松軟。
（2）雞樅菌：菌肉緊致、平實。
