農業防治：選擇排水能力強的沙質土壤地塊種植并采取高壟栽培，管理期間適當增施磷鉀肥，及時中耕除草，提高抗病能力。
化學防治：育苗時使用多菌靈或托布津進行拌種處理，移栽前使用70%敵克松進行土壤消毒并使用波爾多液對種苗進行消毒處理，發病后拔除病株，于病穴中施加石灰粉，并在發病區域噴灑50%甲基托布津800-1000倍液。
一、怎么防治當歸根腐病
1、發病癥狀
（1）主要危害根、莖。
（2）發病植株根部組織初呈褐色，進而腐爛成水浸狀，只剩下纖維狀空殼。
（3）莖呈褐色水漬狀，地上部分生長停止，植株矮小。
（4）葉片上出現橢圓形褐色斑塊，嚴重的葉片枯黃下垂，終整株死亡。
2、防治方法
（1）選擇排水良好、透水性強的沙質土壤作栽培地；實行高壟栽種，實行輪作。
（2）加強田間管理，適當增施磷鉀肥，及時中耕除草，提高植株抗病能力。
（3）移栽前，用70%敵克松進行土壤處理；選用健壯無病種苗移栽，如移栽前用1:1:150的波爾多液浸泡10~15分鐘后晾干栽植，或育苗時用多菌靈、托布津按種子重量的0.3%~0.5%拌種。
（4）發病后及時拔除病株，集中燒毀，病穴中施一撮石灰粉，并用50%甲基托布津800~1000倍液噴灑病區，以防蔓延。
二、當歸根腐病的發病規律
1、病原菌以菌絲和分生孢子在病田土壤內或當歸種苗上越冬，成為翌年的初次侵染源。
2、5月初開始發病，6月危害嚴重，7~8月達到發病高峰，9月因氣溫下降，病勢逐漸減輕。
3、病菌在土中分布多集中在耕作層，高溫高濕有助于病害的發生。
4、地下害蟲活動頻繁，根部傷口多，利于發病，連作會加重病害發生。
