山藥的病害主要有炭疽病、葉斑病、莖腐病和根結線蟲病。防治炭疽病和葉斑病可選用70％代森錳鋅600倍液、80％炭疽福美500倍液用75％百菌清600倍液灌根防治莖腐病；防治根結線蟲病，可使用30％克菌丹，每667m2用量為1kg，播種前混入土壤中消毒。蟲害主要有菜葉蜂和溝金針蟲等，防治菜葉蜂用90％敵百蟲1000倍液噴霧，防治溝金針蟲用辛硫磷800倍液灌根。從6月中旬開始，根據田間病蟲害情況，殺蟲、殺菌藥各噴4～5次，前期重在防蟲，可用敵百蟲等高效低毒農藥，后期重在防病，特別是高溫多雨季節，是病菌傳播發展的最佳季節，可用代森錳鋅、甲基托布津等殺菌農藥。
麻山藥紅斑病：麻山藥紅斑病是近年來發現的一種重的新病害，經鑒定病原是一種短體線蟲，只危害麻山藥，主要侵染麻山藥的根和塊莖，在莖上形成褐色，近圓行或不規則形的斑點，單個病斑較小，直徑約2-3毫米，但受害重的塊莖上，病斑密集，聯成大片暗褐色斑塊，表面龜裂。病斑一般深2-3毫米，最深可達1厘米以上，病組織呈紅褐色干腐狀，生長期間危害、影響塊莖發育，塊莖省、重量輕，重病田可減少60%以上。用病塊莖加工光條，為了刮去紅斑，刮皮損失增加10-30%。研究證明，病蘆頭(種秧)殘體和病田土壤是傳病的主要途徑，病原線蟲在土壤中可存活3年以上，圓豆(珠芽)不傳病。
追肥
山藥除要有充足的基肥外，還要進行追肥，以滿足山藥生長的需要。一般在第2次或第3次澆水時進行第1次追肥，每667m2追施尿素10kg。在山藥豆開始膨大時進行第2次追肥，每667m2追施硫酸鉀復合肥30kg。在山藥豆長成，有的山藥豆開始脫落時進行第3次追肥，每667m2追施硫酸鉀復合肥20kg。6月20日前后追施鉀鎂肥，每畝20公斤，促使山藥由營養生長向生殖生長轉化。
噴生物調節劑
6月20日前后，山藥莖葉生長已基本滿足生殖生長的需要，此時噴多效唑以抑制山藥枝蔓生長。
控制山藥豆生長
山藥豆生長與地下塊莖生長爭奪養分，目前無很好的措施控制山藥豆生長，可適時采摘部分山藥豆，以促進塊莖生長。
