金針菇的長短直接影響總產量，下面介紹幾種措施供廣大菇農參考。
1、及時清理料面，采收后及時清除料面殘留的菇腳和小菇，剔除老菌絲，進行搔菌。
2、含水量要合適：袋栽金針菇培養科的含水量65%~70%，才能保證正常生長及后期順利轉潮，培養科較平時可在袋內加入清水，2~4小時后倒出多余的水分，一般每袋補水50~100毫升。
3、合理調控溫度：金針菇原基形成最適溫度為13℃～15℃，如氣溫偏高，在菇房空閑地噴水，通風降溫、氣溫偏低可噴熱水或給菇房加溫。 4、適當通風除濕：在出菇階段為收到蓋小、柄長、色淺、肥嫩的優質金針菇，在菌袋上覆蓋一層地膜，從保濕度，創造一個二氧化碳濃度較高的微環境。但高濕度，高二氧化碳濃度不利于重新催蕾，可在早晚揭膜通風。
5、給予微弱的散射光：在微弱射光環境條件下易形成較多菇原基，管理上采取“三分陽，七分陰”，加快菇原基的分化，形成菇蕾。
6、謹防四周出菇：四周出菇會影響轉潮，可在培養科中加入20%的雜木屑。可防止四周出菇，還能促進菇原基的形成。
7、翻轉掉頭出菇：第二潮菇采摘后，掉頭在另一端出菇，可使轉潮加快，產量也較高。
8、預防病蟲害和補充營養液：清潔菇房環境遠離雜菌源，通風口設網紗防蟲。定期噴0.2%石灰液。有蟲害的可用10%敵百蟲或2000倍的敵敵畏噴霧。采摘后期可在菌袋中注入1000倍的恩肥營養液，不但能提高產量，還能刺激菇原基形成。
