一、埋藏法在貯藏窖或室內，先鋪6—9厘米的干沙子，擺放20—30厘米厚的無病、無蟲、無機械損傷的辣椒，再鋪放9—12厘米的沙子。如此堆放1—3層。也可用筐或木箱裝辣椒，離箱、筐上口5—7厘米處覆蓋濕潤的泥沙。把筐、箱堆4—5層，在最高層覆蓋30厘米厚濕潤的泥沙。窖或室內保持貯藏適溫，可貯藏50—60天。
二、窖藏法選土質堅實、地勢高燥的地塊，挖地下窖。窖壁要堅實，底墊磚塊，窖口用塑料薄膜封閉，防止雨淋和凍害。辣椒在窖內的存放形式有：
1.筐貯：將挑選好的辣椒放在筐中。筐內墊紙或薄包，裝后加蓋。將筐堆垛。
2.架貯：在窖內作成1—2米高的架子，分成3層。將辣椒平鋪在架上。
3.散藏：在地面鋪上稻草，上放辣椒30厘米厚，堆成一長條，上蓋草苫子。窖內的蒲包、草苫子等均應保持濕潤，并保持窖溫7—9℃，每15天可檢查1次。
4.塑料薄膜氣調貯藏法：將經過挑選的辣椒裝入消過毒的板條箱內，每箱裝10公斤左右，按“丁”字形堆放。每垛堆48箱。最上層覆蓋麻袋或牛皮紙等，防止水滴落在果上和避免光照直射辣椒。底層放生石灰5—7公斤，以吸收二氧化碳。外層罩上塑料膜賬子，密封隔絕外界空氣后，即抽氧充入氮氣。一開始把氧含量降到2—5%。經數天后，將氧調節在5%以內。呼吸產生的二氧化碳，用增加消石灰的辦法吸收，使其含量也控制在5%以內。每隔10—12天揭賬倒動1次，擦干薄膜上的水滴，剔除腐爛果實。如無抽氧充氮裝置，也可用自然降氧的方法。即利用果實自行呼吸使氧降低到5%左右。
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