芋頭的淀粉含量高，比較耐貯運。不過由于生長于潮濕的環境，在高溫下容易感染干腐病與黑腐病。芋頭對低溫也比較敏感，在5℃以下的低溫會造成冷害，失去商品價值。安全的貯藏溫度是7－10℃。
芋頭成熟時部分葉片變黃，應及時停止供水。收獲時先挖出一邊的泥土，然后抓緊莖葉向內拉。這樣收獲的芋頭機械傷少。去除莖葉以后，可以把母芋與子芋分開，放在通風的地方晾干幾天，再放在陰涼的地方貯藏。也可以不把母子分開，讓大小抱在一起，等泥土晾干后一起貯藏。
芋頭的貯藏也比較簡單，可以在陰涼的地方堆放，也可以用籮筐盛裝以后再堆疊起來。最好的溫度范圍是7－10℃，相對濕度不能太高，不干不濕，85％比較適當。在這樣的貯藏環境條件下，管理得當可藏半年時間。管理工作中的突出問題是通風，通風能夠大大減少病害的發生。
外銷芋頭，如果客戶要求不帶泥包裝，那么，必須注意，因為在清洗過程最容易造成大大小小的傷口，所以清洗之后，應該進行消毒。簡便的辦法是把清洗的芋頭放入消毒液中浸一浸，撈起晾干或吹干，然后逐個用紙包好，再平放入紙箱，彼此靠緊。記住，切不可與其他耐低溫的果菜同倉共運。
浸洗的消毒液可用200－300倍的漂白粉，也可用500－1000倍的洗潔精，或再加上某種通用的殺菌劑，500－1000倍。
