有機佛手瓜若采取種子繁殖法，在種子催芽后，可以在25℃條件下栽植。首先，施肥整地，每畝施優質腐熟粗肥1萬千克，然后做成1米寬的大壟，也可按1米的行距挖寬、深各80厘米的大埯，施足優質粗肥，按1米的株距，將種瓜的瓜蒂端朝上（也即種瓜出芽的一端朝下），將果實的2／3埋在穴內，接著燒水培土即可。為了保濕保溫，可覆蓋塑料膜，并注意防止膜或膜上的水滴接觸種瓜，否則易爛瓜。一般5～8天即可出苗。如果有苗，則按株行距20厘米栽植種瓜，當長出幼苗后，再按一定株行距定植，定植時可一鍬一株帶土坨移栽。
若采用插條法育苗，可在生長旺盛的植株上，選用15厘米長的老莖，用生根粉蘸根后，按照15厘米的株距、30度角斜插，在地表上留1～2個腋芽。在25℃氣溫下，保持土壤潮濕，經7～10天即可生根出芽，待長成幼苗時即可移栽。
采用壓條法育苗，可在生長旺盛的植株上，選1～3枝粗壯的蔓壓到地表，每隔4～5節壓一把土，土埋2節，露出2～3節，并注意壓條的頂芽不可埋土，以保證枝條正常生長。這樣，在保溫保濕的情況下，一般經7～10天即可生根。這時可用剪刀在培土的后方位置剪斷，使其脫離母體，成為獨立的幼小植體，再培養1周左右就可作為幼苗進行移栽。
