番荔枝鮮果易爛,不易貯存,一般放在稻草中后熟幾天就變軟,若留在樹上會裂開、腐敗，而不是變軟。為防果實采后腐爛，先用流水把果實清洗，再用50-52℃苯萊特藥液（有效0.5成份%)藥液浸果5分鐘,然后用流水降溫,瀝于,打蠟,以降低呼吸強度,應于鮮果末軟熟之前上蠟,濃度以0.3%-10.0%為宜.上好蠟的果實要用紙箱饈,內用軟紙墊隔,然后放在冷凍保鮮庫中冷藏.由于番荔枝鮮果在15.5℃以下受寒害,冷藏溫度不宜太低,一般在16℃條件下,相對濕度90%以上環境下貯藏較合適,可存放半個月左右.番荔枝不僅適應性強‘粗生易栽和病蟲害少，而且經濟效益高。
對于耐藏性極差的番荔枝來說，低溫乃是降低其呼吸速率，延長其貯藏期的重要條 件.然而，番荔枝在較低的溫度((10℃以下)下貯藏，會與其它熱帶水果一樣，出現冷害，表現在果皮逐漸變黑，呼吸機制嚴重破壞，果實堅硬，不會軟熟。而溫度過高則使果實軟熟加速，腐爛加重.我們研究認為，番荔枝貯藏適溫，應根據果實成熟度情況確定，低熟度(八成以下)果實以18 ~20℃,中熟度(八一九成)果實以15一18℃為宜，而高熟度(九成以上)果實以12 ~ 15攝氏度最佳.
氣調貯藏可以保持果實硬度，明顯抑制果實軟化。通過免疫檢測發現氣調下與pg酶相關的蛋白質表達受到了抑制，使pg酶的活性降低。在20℃下，20%的co? 可抑制番荔枝果實1,5一二磷酸核酮糖梭化酶的活性，阻礙葉綠素的損失，保持果皮綠色，延遲果實衰老。
