灰霉病、菌核病和綿疫病是導致茄子爛果的三大病害。每到冬季，棚內低溫高濕的環境極易引起這三種病害的大發生。有時候多種病害混合侵染，給防治帶來了困難。
灰霉病主要為害茄子的幼果，也可為害葉片和莖稈。果實受害一般先是侵染殘留的花瓣、花萼，然后向果實和果柄發展，從而使果皮變成灰白色軟腐，發病后期在病斑處長出灰白色霉層，以后果實失水僵化。綿疫病則容易使果實形成水漬狀腐爛，并伴有白霉，果實落地。菌核病與綿疫病相似，都有白色的菌絲，但是兩者的區別在于菌核病的菌絲濃密，后期擰結成核，而綿疫病的菌絲較為稀疏，而且菌核病往往是導致果柄受害，進而造成落果。
這三種病害都是由于低溫高濕引起的，因此要想防治這三種病害首先要創造不適宜病害發生的環境條件，即提高棚溫，降低濕度。深冬期間，為保證白天棚溫，菜農可適當延遲通風時間，待棚內溫度升到30℃左右時，方可通風降濕，下午2點以后如棚溫下降，要及時關閉放風口，待棚溫降至20℃左右時，放下草簾保溫，保證夜間溫度在12℃以上。另外，通過鋪設地膜、行間鋪秸稈等措施也可有效降低棚溫。為了降低濕度，增加植株間的通風透光性，菜農還應注意摘葉打杈，摘除爛果，一般植株最底下的茄子下面留下兩片葉即可滿足膨果所需。對于灰霉病和菌核病，很重要的一點是要及時摘除茄子幼果上的殘花及柱頭，這樣可有效防住爛果。
對灰霉病和菌核病的防治，菜農應采取“蘸、噴、熏”三結合的措施。由于灰霉病菌首先侵染殘花，所以菜農在蘸花時可加入防治灰霉病的藥物，如撲海因、咯菌氰等，用這個辦法蘸花防灰霉比拾花效果更好；噴即在一批花即將開放時噴用撲海因或施佳樂等藥劑，同時注意噴藥要全面，墻體、立柱等地方也要噴藥；針對病菌孢子主要通過氣流傳播的特點，可采取煙霧熏蒸，如菌核凈、百菌清煙劑等，畝用藥200克，熏棚6-8小時。綿疫病屬于卵菌，發病初期可噴灑普力克800倍或甲霜靈錳鋅800倍等，發病嚴重時可噴灑烯酰嗎啉錳鋅600倍混銀法利600倍或氰霜唑1000倍進行防治。
