１、豆子要精選。生豆芽時應選擇無霉變、無蟲蛀、子粒飽滿的豆子，浸泡前用０．５％的石灰水進行沖洗，也可用熱水燙一下，以消毒殺菌，促進豆內酶的活性，提高豆子發芽率。
２、場地要清潔。場地內應裝４０瓦的紫外線殺菌燈，經常開燈殺菌。生產場地由專人管理，杜絕外人進入，豆芽生產人員嚴禁接觸油污、化學藥品。
３、器具要消毒。生豆芽的容器要保持清潔，一般可用０．５％的漂白粉或５％的明礬溶液沖洗，也可用火把灼燒幾遍，使附著在上面的病原體死亡。
４、溫度要適宜。豆芽生長的適宜溫度為２０℃～２５℃。在生產過程中必須調節室溫，使豆芽在適宜的溫度條件下生長，盡量避免爛芽。
５、操作要科學。夏季生豆芽的關鍵是泡豆，用水量以豆子泡好后水基本吸干為佳。要求在豆子泡好前１小時內每１０分鐘翻攪１次，以使豆子均勻吸水。若吸水太多，入缸后豆子呼吸吐納的空間小，豆子發芽就慢，而且易染病；若吸取水少，則發芽時間不一致，參差不齊，外觀不美。
６、殺菌要適時。在豆芽爛芽初期用８５０３藥劑一小包，對水２．５公斤后噴灑，每４小時噴１次，抑制病菌蔓延。此外，還可用ｅｊ－２型消毒劑稀釋２００倍液噴灑，控制病情發展
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