木耳發生流耳病時，受害耳片前期呈淡黃色至咖啡色，表面發黏，有腥臭味，后期致整叢木耳腐爛。從致病原因上看，流耳是由線蟲、細菌和原生動物綜合作用的結果，其中線蟲是產生流耳的主要原因。
流耳的防治措施如下：
1.氣溫高時及時降溫。窗口懸掛濕簾，噴水降溫，夜間打開門窗通風降溫，盡可能將溫度控制在30℃以內。在這樣的溫度條件下，不僅木耳出耳快，出耳齊，開片好，色澤正，而且線蟲的生長繁殖受到一定的抑制，若溫度超過30℃，則線蟲繁殖加快，容易產生流耳。
2.耳棚場地應有一定坡度，表層土以沙質土壤為好，以便于滲水。
3.水源清潔衛生，以潔凈的深井水作水源最佳。
4.精心管理。木耳在不同的生長階段對溫度、濕度和通風的要求是不同的。在木耳原基形成期，保持相對濕度在80%左右，并適度通風。在原基分化形成期，珊瑚狀耳芽相當幼嫩，此時相對濕度不宜過大，保持在80%-90%即可。在子實體生長階段，為促進耳片快速生長，要加大通風，相對濕度控制在90%-95%。當子實體耳片充分展開、邊緣變薄、耳根收縮、八分成熟時即開始采收。
5.發生少量流耳時，先清除流耳，再用1%-2%的食鹽水噴灑木耳，同時用5%的石灰水噴灑地面，以控制線蟲、細菌的進一步蔓延。
